Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.26381 Spg3aspastic paraplegia 3A homolog (human) 12    73991 
 Gene Ontology DNA binding | GTP binding | GTPase activity | immune response | integral to membrane | nucleus
 Human Homolog SPG3A[spastic paraplegia 3A (autosomal dominant)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 58 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGAGTGCTTAT (3)
GCAAGACGTT (3)
TTAGAAGTGA (3)
130.013
Cb medulloblastomaTACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureTACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
170.017
P8 GC+SHH+1d cultureGAGTGCTTAT (3)
TATTTATTAT (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
15.30.0153
3T3 fibroblastsTTAGAAGTGA (3)
3.50.0035
E15 cortexTTAGAAGTGA (3)
4.90.0049
P1 cortexGTTATTTGTC
TATTTATTAT (2)
TTAGAAGTGA (3)
13.50.0135
HypothalamusGCAAGACGTT (3)
TACAAAACAA (2)
TATTTATTAT (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
12.60.0126
E12.5 retinaGCAAGACGTT (3)
TACAAAACAA (2)
TTAGAAGTGA (3)
11.30.0113
E14.5 retinaTGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
10.90.0109
E16.5 retinaGAGTGCTTAT (3)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
16.30.0163
E18.5 retinaGTTATTTGTC
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
29.10.0291
P0.5 retinaTGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
11.80.0118
P2.5 retinaTACAAAACAA (2)
TATTTATTAT (2)
TTAGAAGTGA (3)
17.70.0177
P4.5 retinaGCAAGACGTT (3)
TTAGAAGTGA (3)
9.90.0099
P6.5 retinaGAGTGCTTAT (3)
TATTTATTAT (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
8.40.0084
P10.5 crx- retinaTACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
11.10.0111
P10.5 crx+ retinaGCAAGACGTT (3)
TACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
13.40.0134
Adult retinalTACAAAACAA (2)
TGTTTGAGTT
TTAGAAGTGA (3)
9.30.0093
ONLTACAAAACAA (2)
1.90.0019