Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.27066	Phyh	phytanoyl-CoA hydroxylase	2		16922
Gene Ontology	catalytic activity | fatty acid alpha-oxidation | oxidoreductase activity | peroxisome | protein binding
Human Homolog	PHYH[phytanoyl-CoA hydroxylase (Refsum disease)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 67 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TGTGTTGTTT (4) 9.8 0.0098 P8 Cb GC AATTTAATTA (3) 3.3 0.0033 Cb medulloblastoma TGTGTTGTTT (4) 4.6 0.0046 Cb medulloblastoma AATCCCCAAT (3) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma AATTTAATTA (3) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma GCATCCAAAA (2) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma GGCTGACGGA (2) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture AATTTAATTA (3) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture TGTGTTGTTT (4) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture GGCTGACGGA (2) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture ACTCCTTGGA 1.1 0.0011 P8 GC+1d culture GCATCCAAAA (2) 1.1 0.0011 P8 GC+1d culture GCATCCAAGG (4) 1.1 0.0011 P8 GC+1d culture GGCTCCCAGC (3) 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture TGTGTTGTTT (4) 10.5 0.0105 P8 GC+SHH+1d culture GCATCCAAAA (2) 3.5 0.0035 P8 GC+SHH+1d culture AATTAATTAA (2) 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture AATTTAATTA (3) 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture GGCTGACGGA (2) 1.2 0.0012 E15 cortex TGTGTTGTTT (4) 4.9 0.0049 P1 cortex TGTGTTGTTT (4) 9.1 0.0091 P1 cortex AATTAATTAA (2) 4.5 0.0045 Hypothalamus GCATCCAAAA (2) 5.4 0.0054 Hypothalamus TGTGTTGTTT (4) 5.4 0.0054 Hypothalamus AATTAATTAA (2) 1.8 0.0018 Hypothalamus AATTTAATTA (3) 1.8 0.0018 Hypothalamus GGCTGACGGA (2) 1.8 0.0018 E12.5 retina GCATCCAAGG (4) 9.4 0.0094 E12.5 retina TGTGTTGTTT (4) 3.8 0.0038 E12.5 retina AATCCCCAAT (3) 1.9 0.0019 E12.5 retina GCATCCAAAA (2) 1.9 0.0019 E14.5 retina TGTGTTGTTT (4) 3.6 0.0036 E14.5 retina AATTAATTAA (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina TGTGTTGTTT (4) 3.6 0.0036 E16.5 retina AATTAATTAA (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina GCAATCAAGG (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina GGCTCCCAGC (3) 1.8 0.0018 E18.5 retina GCATCCAAAA (2) 5.5 0.0055 E18.5 retina TGTGTTGTTT (4) 3.6 0.0036 P0.5 retina TGTGTTGTTT (4) 5.9 0.0059 P0.5 retina AATTTAATTA (3) 2 0.002 P2.5 retina TGTGTTGTTT (4) 8.8 0.0088 P2.5 retina AATTAATTAA (2) 5.3 0.0053 P2.5 retina GCATCCAAAA (2) 1.8 0.0018 P2.5 retina GGCTGACGGA (2) 1.8 0.0018 P4.5 retina TGTGTTGTTT (4) 11.9 0.0119 P4.5 retina GGCTCCCAGC (3) 2 0.002 P4.5 retina GGCTGACGGA (2) 2 0.002 P6.5 retina TGTGTTGTTT (4) 13.3 0.0133 P6.5 retina AATTAATTAA (2) 10 0.01 P6.5 retina AATTTAATTA (3) 1.7 0.0017 P6.5 retina GCATCCAAAA (2) 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina TGTGTTGTTT (4) 9.3 0.0093 P10.5 crx- retina AATTAATTAA (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TGTGTTGTTT (4) 5.8 0.0058 P10.5 crx+ retina AATTAATTAA (2) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina AATTTAATTA (3) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina GCATCCAAAA (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina GGCTGACGGA (2) 1.9 0.0019 Adult retinal GCAATCAAGG (2) 3.7 0.0037 Adult retinal AATTAATTAA (2) 1.9 0.0019 Adult retinal AATTTAATTA (3) 1.9 0.0019 Adult retinal GCATCCAAGG (4) 1.9 0.0019 ONL GCATCCAAGG (4) 7.7 0.0077 ONL AATTAATTAA (2) 1.9 0.0019 ONL AATTTAATTA (3) 1.9 0.0019 ONL TGTGTTGTTT (4) 1.9 0.0019