Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.27066	Phyh	phytanoyl-CoA hydroxylase	2		16922
Gene Ontology	catalytic activity | fatty acid alpha-oxidation | oxidoreductase activity | peroxisome | protein binding
Human Homolog	PHYH[phytanoyl-CoA hydroxylase (Refsum disease)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 24 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AATTTAATTA 3.3 0.0033 Cb medulloblastoma AATCCCCAAT 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma AATTTAATTA 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture AATTTAATTA 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture ACTCCTTGGA 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture AATTAATTAA (2) 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture AATTTAATTA 1.2 0.0012 P1 cortex AATTAATTAA (2) 4.5 0.0045 Hypothalamus AATTAATTAA (2) 1.8 0.0018 Hypothalamus AATTTAATTA 1.8 0.0018 E12.5 retina AATCCCCAAT 1.9 0.0019 E14.5 retina AATTAATTAA (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina AATTAATTAA (2) 1.8 0.0018 P0.5 retina AATTTAATTA 2 0.002 P2.5 retina AATTAATTAA (2) 5.3 0.0053 P6.5 retina AATTAATTAA (2) 10 0.01 P6.5 retina AATTTAATTA 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina AATTAATTAA (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina AATTAATTAA (2) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina AATTTAATTA 1.9 0.0019 Adult retinal AATTAATTAA (2) 1.9 0.0019 Adult retinal AATTTAATTA 1.9 0.0019 ONL AATTAATTAA (2) 1.9 0.0019 ONL AATTTAATTA 1.9 0.0019