Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.273251	Sdh1	sorbitol dehydrogenase 1	2	2 66.0 cM	20322
Gene Ontology	alcohol dehydrogenase activity, zinc-dependent | L-iditol 2-dehydrogenase activity | oxidoreductase activity | zinc ion binding
Human Homolog	SORD[sorbitol dehydrogenase]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 182 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT GGGCTGCTGG (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) 88.1 0.0881 Cb medulloblastoma GCCCAGACCT GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTAAAAAGAA (5) TTCAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 221.9 0.2219 P8 GC+1d culture AGGCTGCTGG ATTTTTTTTT (4) GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTAAAAAGAA (5) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) 124.3 0.1243 P8 GC+SHH+1d culture AGCAGGAGCA ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT GGGGGCAGGC GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAACA (2) TTAAAAAAGA (2) TTAAAAAGAA (5) TTAAAAGAAA (2) TTAAAGAAAA TTAAGAAAAA (4) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) TTTAAAAAAA (3) 194.6 0.1946 3T3 fibroblasts AGGCTGCTGG GCCCAGACCT GGGGGCAGGC GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) 28 0.028 E15 cortex AGGCTGCTGG GCCCAGACCT GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTCAAAAAAA (2) 59.2 0.0592 P1 cortex ATTTTTTTTT (4) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAGAAA (2) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) 81.6 0.0816 Hypothalamus GCCCAGACCT GGGCTGCTGG (2) GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAGAAAA TTCAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 86.9 0.0869 E12.5 retina AGCAGGAGCA GCCCAGACCT GGCAAGGCCC TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) TTTAAAAAAA (3) 60.2 0.0602 E14.5 retina AGCAGGAGCA ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAACA (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 105.5 0.1055 E16.5 retina AGCAGGAGCA AGGCTGCTGG GCCCAGACCT GGGCTGCTGG (2) TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAACA (2) TTCAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 63.3 0.0633 E18.5 retina ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT GGCAAGGCCC TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTAAAGAAAA TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) TTTAAAAAAA (3) 227.2 0.2272 P0.5 retina ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 74.7 0.0747 P2.5 retina AGCAGGAGCA ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAGAAAAA (4) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) TTTAAAAAAA (3) 147.9 0.1479 P4.5 retina ATTTTTTTTT (4) GCCCAGACCT GGCAAGGCCC GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) TTTAAAAAAA (3) 241.7 0.2417 P6.5 retina AGGCTGCTGG GGCAAGGCCC GGGCTGCTGG (2) GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTAAAGAAAA TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) TTTAAAAAAA (3) 115.2 0.1152 P10.5 crx- retina GCCCAGACCT TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) 37.2 0.0372 P10.5 crx+ retina AGCAGGAGCA GCCCAGACCT GGCAAGGCCC GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAACA (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) 63.3 0.0633 Adult retinal GGCAAGGCCC GGGGGCAGGC GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAGA (2) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) 42.8 0.0428 ONL AGCAGGAGCA GGCAAGGCCC GGGGGCAGGC GGGGGGGGGG TAAAAAAAAA (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAAGA (2) TTAAAAGAAA (2) TTAAGAAAAA (4) TTCAAAAAAA (2) TTGGAAAAAA (3) TTTAAAAAAA (3) 68.8 0.0688