Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.273874	Pfkp	phosphofructokinase, platelet	13		56421
Gene Ontology	6-phosphofructokinase activity | 6-phosphofructokinase complex | ATP binding | catalytic activity | cytoplasm | glycolysis | kinase activity | magnesium ion binding | transferase activity
Human Homolog	PFKP[phosphofructokinase, platelet]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 141 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATCTTGTGTT (4) CATTAAATGA (2) TCTTAGGGTC TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT TGTTGTCTGT 29.3 0.0293 Cb medulloblastoma ACCACTGGCT ACCAGTTCAG CAAAAATAAG CATTAAATGA (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTTGTCTGT 32.3 0.0323 P8 GC+1d culture ACCACTGGCT AGTCTATGGG ATCTTGTGTT (4) CAAAAATAAG GGTCAGACTT (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT TGTTGTCTGT 14.6 0.0146 P8 GC+SHH+1d culture ACCACTGGCT CATTAAATGA (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT TGTTGTCTGT 18.8 0.0188 3T3 fibroblasts AGTCTATGGG GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTT (2) 17.5 0.0175 E15 cortex GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTT (2) 9.8 0.0098 P1 cortex AGTCTATGGG CATTAAATGA (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) 59 0.059 Hypothalamus ACCACTGGCT ACCAGTTCAG ATCTTGTGTT (4) CAAAAATAAG CAGGGTAAGT CATTAAATGA (2) CGAATCTACA TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 36.1 0.0361 E12.5 retina CATTAAATGA (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 28.1 0.0281 E14.5 retina ACCACTGGCT AGTGACTTGG (2) ATCTTGTGTT (4) CAAAAATAAG CATTAAATGA (2) TCTTAGGGTC TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT TGTTGTCTGT 47.2 0.0472 E16.5 retina ATCTTGTGTT (4) CATTAAATGA (2) CGAATCTACA TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 77.8 0.0778 E18.5 retina ATCTTGTGTT (4) CATTAAATGA (2) CGAATCTACA TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 50.8 0.0508 P0.5 retina ACCAGTTCAG CATTAAATGA (2) GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 41.2 0.0412 P2.5 retina ACCAGTTCAG AGTCTATGGG AGTGACTTGG (2) CAAAAATAAG CATTAAATGA (2) CTTCAGCCTT (2) GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 75.9 0.0759 P4.5 retina ACCACTGGCT ACCAGTTCAG AGTCTATGGG AGTGACTTGG (2) ATCTTGTGTT (4) ATGGGCCGCA CAAAAATAAG CAGGGTAAGT CATTAAATGA (2) CTTCAGCCTT (2) GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT 93.2 0.0932 P6.5 retina ACCACTGGCT ACCAGTTCAG ATCTTGTGTT (4) ATGGGCCGCA CATTAAATGA (2) CTTCAGCCTT (2) GTCATAGCTG (2) TCTTAGGGTC TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) TGTATTTCTT TGTTGTCTGT 76.9 0.0769 P10.5 crx- retina AGTCTATGGG ATCTTGTGTT (4) CATTAAATGA (2) CGAATCTACA TCTTAGGGTC TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) 76.3 0.0763 P10.5 crx+ retina ATCTTGTGTT (4) ATGGGCCGCA TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) 51.9 0.0519 Adult retinal ACCAGTTCAG ATGGGCCGCA CTTCAGCCTT (2) GGTCAGACTT (2) GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTG (3) TGTATGTCTT (2) 52.1 0.0521 ONL ACCACTGGCT CAGGGTAAGT CATTAAATGA (2) CTTCAGCCTT (2) GGTCAGACTT (2) GTCATAGCTG (2) TGTATGTCTT (2) 34.3 0.0343