Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.276856	Rpl11	ribosomal protein L11	4		67025
Gene Ontology	cytosolic large ribosomal subunit (sensu Eukarya) | intracellular | protein biosynthesis | ribonucleoprotein complex | ribosome | RNA binding | rRNA binding | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPL11[ribosomal protein L11]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 163 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATGATAATGG (3) CACTGGTTCC (5) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC CGGGAACTGC GCCTCCTCCT TGTGTGCCTG TTAAAAAAAA (2) 261.1 0.2611 Cb medulloblastoma CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC CGCTGGTTTC GGAGGTAGAG GGGGAACTGC (2) TTAAAAAAAA (2) 196.5 0.1965 P8 GC+1d culture ATGATAATGG (3) ATGCACTTTT CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT TTAAAAAAAA (2) 211.1 0.2111 P8 GC+SHH+1d culture ATGATAATGG (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT TTAAAAAAAA (2) 230.7 0.2307 3T3 fibroblasts CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT TGGTGCTGGG (2) TGTGTGCCTG 126.2 0.1262 E15 cortex ATGATAATGG (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCC CGGGAACTGC TTAAAAAAAA (2) 326.4 0.3264 P1 cortex ATGATAATGG (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC TTAAAAAAAA (2) 45.4 0.0454 Hypothalamus ATGATAATGG (3) ATGCACTTTT CCCTGGTTCC (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT GGGGAACTGC (2) TGCATACATA TTAAAAAAAA (2) 188.2 0.1882 E12.5 retina ATGATAATGG (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC TTAAAAAAAA (2) 253.5 0.2535 E14.5 retina ATGATAATGG (3) CACTGGTTCC (5) CCCTGGTTCC (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCA CGCTGGTTCC CGCTGGTTTC CGGGAACTGC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT GGAGGTAGAG TGGTGCTGGG (2) TTAAAAAAAA (2) 458.9 0.4589 E16.5 retina ATGATAATGG (3) CCCTGGTTCC (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT TGGTGCTGGG (2) TTAAAAAAAA (2) 472.6 0.4726 E18.5 retina ATGATAATGG (3) CCCTGGTTCC (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT TGCATACATA TGGTGCTGGG (2) TTAAAAAAAA (2) 332.8 0.3328 P0.5 retina ATGATAATGG (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCA CGCTGGTTCC CGTTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT TGCATACATA TGTGTGCCTG TTAAAAAAAA (2) 210.4 0.2104 P2.5 retina ATGATAATGG (3) ATGCACTTTT CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT TGCATACATA TTAAAAAAAA (2) 235.7 0.2357 P4.5 retina ATGATAATGG (3) ATGCACTTTT CCCTGGTTCC (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCC CGGGAACTGC CGTTGGTTCC GCCTCCTCCT GGAGGTAGAG TGCATACATA TGGTGCTGGG (2) TTAAAAAAAA (2) 244 0.244 P6.5 retina ATGATAATGG (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCA CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT GGAGGTAGAG TGCATACATA TGTGTGCCTG TTAAAAAAAA (2) 143.3 0.1433 P10.5 crx- retina ATGATAATGG (3) CACTGGTTCC (5) CGCTGGGTCC CGCTGGTTCC CGCTGGTTTC CGGGAACTGC CGTTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT GGGGAACTGC (2) TGTGTGCCTG TTAAAAAAAA (2) 397.8 0.3978 P10.5 crx+ retina ATGATAATGG (3) CCCTGGTTCC (3) CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT GGAGGTAGAG TGCATACATA TGTGTGCCTG TTAAAAAAAA (2) 211.3 0.2113 Adult retinal ATGATAATGG (3) ATGCACTTTT CCCTTCTTCT (3) CGCTGGTTCC GCCTCCTCCT GCCTCCTCTT GGAGGTAGAG TGGTGCTGGG (2) TGTGTGCCTG TTAAAAAAAA (2) 79.8 0.0798 ONL ATGATAATGG (3) CGCTGGTTCC CGCTGGTTTC TGGTGCTGGG (2) TTAAAAAAAA (2) 103.4 0.1034