Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.282039 AclyATP citrate lyase 11    104112 
 Mm.282039 A730098H14RikRIKEN cDNA A730098H14 gene 11    319932 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 142 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGCCTTGGC (2)
GAACATTTCA (3)
GATCTTTGTG
GGGGCAGGGA
TAAGCCAAGG (3)
TGCAACAATG (2)
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
48.80.0488
Cb medulloblastomaAGGCCTTGGC (2)
GAACATTTCA (3)
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGCAACAATG (2)
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
39.20.0392
P8 GC+1d cultureCAGCCGACTT (2)
CTCAGGAACT (2)
GAACATTTCA (3)
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGCAACAATG (2)
TGGATGCCTG
TGGTGTAGTA (2)
TTTGCTTTAA (3)
47.90.0479
P8 GC+SHH+1d cultureCAGACATCTC (2)
GAACATTTCA (3)
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TCTCTCCCAG
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
53.80.0538
3T3 fibroblastsGGGGCAGGGA
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
17.50.0175
E15 cortexGGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGGATGCCTG
39.60.0396
P1 cortexGCAGCTTACA
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
31.80.0318
HypothalamusAGGAGATGGG
AGGCCTTGGC (2)
CAGACATCTC (2)
CTCAGGAACT (2)
TAAGCCAAGG (3)
TCTCTCCCAG
TGCAACAATG (2)
TTTGCTTTAA (3)
39.70.0397
E12.5 retinaGAACATTTCA (3)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
TGGATGCCTG
TGGTGTAGTA (2)
TTACAGACCC
TTTGCTTTAA (3)
48.90.0489
E14.5 retinaGAACATTTCA (3)
GAAGGCCGAC (2)
GCAGCTTACA
GTGTCTCTTC
TGGTGTAGTA (2)
TTTGCTTTAA (3)
67.30.0673
E16.5 retinaAGGCCTTGGC (2)
CAGACATCTC (2)
CAGCCGACTT (2)
GAACATTTCA (3)
GGGGCAGGGA
TAAGCCAAGG (3)
TGGATGCCTG
TGGTGTAGTA (2)
TTTGCTTTAA (3)
75.90.0759
E18.5 retinaGAACATTTCA (3)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGCAACAATG (2)
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
67.20.0672
P0.5 retinaAGGCCTTGGC (2)
CAGACATCTC (2)
CTCAGGAACT (2)
GAACATTTCA (3)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
66.90.0669
P2.5 retinaAGGAGATGGG
CAGACATCTC (2)
GAACATTTCA (3)
GAAGGCCGAC (2)
GATCTTTGTG
GGGGCAGGGA
TGGATGCCTG
TGGGATGGCT (2)
TTTGCTTTAA (3)
670.067
P4.5 retinaGAAGGCCGAC (2)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
73.40.0734
P6.5 retinaGAACATTTCA (3)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TAAGCCAAGG (3)
TGGATGCCTG
TTTGCTTTAA (3)
85.10.0851
P10.5 crx- retinaAGGAGATGGG
CAGACATCTC (2)
GAACATTTCA (3)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
TCTCTCCCAG
TGCAACAATG (2)
TGGATGCCTG
TTACAGACCC
TTTGCTTTAA (3)
61.50.0615
P10.5 crx+ retinaAGGCCTTGGC (2)
CAGCCGACTT (2)
CTCAGGAACT (2)
GAACATTTCA (3)
GAAGGCCGAC (2)
GCAGCTTACA
GGGGCAGGGA
TGCAACAATG (2)
TGGATGCCTG
TGGTGTAGTA (2)
TTTGCTTTAA (3)
72.90.0729
Adult retinalAGGCCTTGGC (2)
CAGACATCTC (2)
GGGGCAGGGA
GTGTCTCTTC
TGGATGCCTG
TGGGATGGCT (2)
TGGTGTAGTA (2)
TTTGCTTTAA (3)
40.90.0409
ONLGAACATTTCA (3)
GCAGCTTACA
GTGTCTCTTC
TGGGATGGCT (2)
TTTGCTTTAA (3)
34.40.0344