Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.282093	Ubb	ubiquitin B	11	11 35.0 cM	22187
Gene Ontology	nucleus | protein modification
Human Homolog	UBB[ubiquitin B]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 411 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) ACACCTCTAA CAAAATTTTT CAACAAAACC (2) CAGAATGAGC CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCTCTCA GAAATAAAAA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GCAGAATTTT (2) GGAAAAAAAA (2) GGATGGTGGA (3) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCATAG GTAGCATAAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) 660.8 0.6608 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) CAAATCTTCC (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) GAAATAAAAA GAGCAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGAATAAAAG (3) GTAAAAAAAA (2) GTAAAAAGAA GTAAGCAAAA GTAAGCAAAG GTAAGCAAAT GTAAGCACAA GTAAGCATAA GTAAGCGTAA GTAGCATAAA GTAGGCAAAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 1733.9 1.7339 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GCAAAAAAAA (2) GCAGAATTTT (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCAAAC GTAAGCACAA GTAAGCATAA GTAGCATAAA GTAGGCAAAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTGGCAGGCA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 761.1 0.7611 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) ACACCTCTAA CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CAGATTTTTC (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCTCTCA GAAATAAAAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAAAAAGAA GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCAAAG GTAAGCATAA GTAAGCATAG GTAAGCGTAA GTAGCATAAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTGGCAGGCA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 1036.2 1.0362 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) CAGAATGAGC CAGATCTTTG (2) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GCAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTCATAGCTG (2) 80.5 0.0805 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGATGGTGGA (3) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCACAA GTAAGCATAA GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) 573.8 0.5738 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGAATGAGC CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) GCAAAAAAAA (2) GCAGAGAAGT (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCACAA GTAAGCATAA GTCAAAAAAA GTTAAAAAAA (2) 513.3 0.5133 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GCAGAATTTT (2) GCCCCAAACC GGAAAAAAAA (2) GGAATAAAAG (3) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCGTAA GTAGGCAAAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 798.6 0.7986 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) GAGCAAAAAA (2) GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GCCCCAAACC GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCGTAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 589.8 0.5898 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA CCCGGGCAAG GAAATAAAAA GCAAAAAAAA (2) GCAGAGAAGT (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 590.2 0.5902 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GCAGAATTTT (2) GGAAAAAAAA (2) GGATGGTGGA (3) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCATAC (3) GTAGGCAAAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTGGCAGGCA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 617.5 0.6175 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCTCTCA CCCGGGCAAG GAAATAAAAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAAAAAGAA GTAAGCAAAA GTAAGCAAAC GTAAGCAAAT GTAAGCATAA GTAAGCATAC (3) GTAAGCATAG GTAAGCGTAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 1560.5 1.5605 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GAGCAAAAAA (2) GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGAATAAAAG (3) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCAAAG GTAAGCACAA GTAAGCATAA GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 640 0.64 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGAATGAGC CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA CCCGGGCAAG GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCACAA GTAAGCATAA GTAAGCATAG GTAAGCGTAA GTAGCATAAA GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 1038.5 1.0385 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGAATGAGC CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA GAAATAAAAA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGATGGTGGA (3) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCAAAG GTAAGCAAAT GTAAGCATAA GTAAGCATAC (3) GTAAGCGTAA GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 1125.8 1.1258 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGAATGAGC CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCGTAA GTAGGCAAAA GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 833.8 0.8338 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GAAATAAAAA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 434.7 0.4347 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) CAAAATTTTT CAACAAAACC (2) CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCCCTCA CCACCTCTCA GCAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGATGGTGGA (3) GTAAAAAAAA (2) GTAAAAAGAA GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCGTAA GTCAAAAAAA GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) TGAAAGCCCC 699.7 0.6997 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) CAAAATTTTT CAACAAAACC (2) CAGAATGAGC CAGATCTTCG CAGATCTTTG (2) CAGATTTTTC (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCTCTCA GAGGGGAGAA GCAAAAAAAA (2) GCCCCAAACC GGAAAAAAAA (2) GGATGGTGGA (3) GTAAAAAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTAAGCATAC (3) GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) GTGAAAAAAA (2) 389.3 0.3893 ONL AAAAAAAAAA (2) CAAATCTTCC (2) CAGATCTTTG (2) CAGATTTTTC (2) CCAAAAAAAA (3) CCACCTCTCA GAAATAAAAA GCAAAAAAAA (2) GCAGAGAAGT (2) GGAAAAAAAA (2) GTAAAAAAAA (2) GTAACCAAAA (2) GTAAGCAAAA GTAAGCATAA GTCAAAAAAA GTCATAGCTG (2) GTGAAAAAAA (2) GTTAAAAAAA (2) 365.6 0.3656