Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.28480	Fkbp3	FK506 binding protein 3	12		30795
Mm.28480	C730036B14Rik	RIKEN cDNA C730036B14 gene	12		104806
Gene Ontology	ATP binding | ATP dependent helicase activity | helicase activity | hydrolase activity | nucleic acid binding
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 140 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 47.1 0.0471 Cb medulloblastoma AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GATTGTCAAA (2) GCAAAAAACA (4) TTTCTCAAAA 36.9 0.0369 P8 GC+1d culture AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 35.2 0.0352 P8 GC+SHH+1d culture ACACTTTTAT (3) AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 51.6 0.0516 3T3 fibroblasts CACAATCTCC (4) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) TGGCTGCTGG (3) 24.5 0.0245 E15 cortex AGACCCTGTC (2) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) 54.2 0.0542 P1 cortex AGACCCTGTC (2) TTTCTCAAAA 9 0.009 Hypothalamus ACACCTTTTA (2) AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 63.3 0.0633 E12.5 retina ACACTTTTAT (3) AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) GGGGCTTATA (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 80.8 0.0808 E14.5 retina ACACTTTTAT (3) AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 80.1 0.0801 E16.5 retina ACACTTTTAT (3) AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 56 0.056 E18.5 retina AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 129.1 0.1291 P0.5 retina AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) GCAAAAAACA (4) GGGGCTTATA (2) TTTCTCAAAA 47.3 0.0473 P2.5 retina AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 66.8 0.0668 P4.5 retina AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) GCAAAAAACA (4) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 53.6 0.0536 P6.5 retina AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 50.1 0.0501 P10.5 crx- retina AGACCCTGTC (2) CACAATCTCC (4) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 29.8 0.0298 P10.5 crx+ retina ACACCTTTTA (2) AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TTTCTCAAAA 55.6 0.0556 Adult retinal ACACTTTTAT (3) AGACCCTGTC (2) CCTTTCTGCG (3) GACAGTGGAG (4) GACCGTGGAG (4) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) TGGCTGCTGG (3) 46.5 0.0465 ONL AGACCCTGTC (2) GATTGTCAAA (2) GATTGTCTTG (2) GGGGCTTATA (2) TGGCTGCTGG (3) TTTCTCAAAA 47.8 0.0478