Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.287267 4933430H15RikRIKEN cDNA 4933430H15 gene 3    74485 
 Mm.287267 Arhgef11Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11 3    213498 
 Gene Ontology guanyl-nucleotide exchange factor activity
 Human Homolog ARHGEF11[Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 55 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTGTTTATG (4)151.70.1517
P8 Cb GCGAGGGACTTG (6)3.30.0033
P8 Cb GCGTTAAGATTT (4)3.30.0033
P8 Cb GCTCCCTGGCTG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaATTGTTTATG (4)6.90.0069
Cb medulloblastomaGCTTTGGCTT (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaGTTAAGATTT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureATTGTTTATG (4)77.60.0776
P8 GC+1d cultureGTTAAGATTT (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureATTGTTTATG (4)179.10.1791
P8 GC+SHH+1d cultureGAGGGACTTG (6)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureGCTTTGGCTT (7)2.30.0023
3T3 fibroblastsATTGTTTATG (4)10.50.0105
3T3 fibroblastsGCTTTGGCTT (7)70.007
E15 cortexATTGTTTATG (4)9.90.0099
E15 cortexGCTTTGGCTT (7)9.90.0099
P1 cortexATTGTTTATG (4)22.70.0227
P1 cortexGAGGGACTTG (6)4.50.0045
P1 cortexGTTAAGATTT (4)4.50.0045
HypothalamusATTGTTTATG (4)14.50.0145
HypothalamusGAGGGACTTG (6)3.60.0036
HypothalamusGTTAAGATTT (4)3.60.0036
E12.5 retinaATTGTTTATG (4)159.60.1596
E14.5 retinaATTGTTTATG (4)242.30.2423
E14.5 retinaGTTAAGATTT (4)1.80.0018
E16.5 retinaATTGTTTATG (4)170.20.1702
E16.5 retinaGCTTTGGCTT (7)1.80.0018
E16.5 retinaGTTAAGATTT (4)1.80.0018
E18.5 retinaATTGTTTATG (4)351.10.3511
E18.5 retinaGTTAAGATTT (4)7.30.0073
P0.5 retinaATTGTTTATG (4)186.40.1864
P0.5 retinaGTTAAGATTT (4)3.90.0039
P0.5 retinaGCTTTGGCTT (7)20.002
P2.5 retinaATTGTTTATG (4)325.60.3256
P2.5 retinaGTTAAGATTT (4)3.50.0035
P2.5 retinaGAGGGACTTG (6)1.80.0018
P4.5 retinaATTGTTTATG (4)410.10.4101
P4.5 retinaGAGGGACTTG (6)20.002
P4.5 retinaGTTAAGATTT (4)20.002
P4.5 retinaTCCCTGGCTG (5)20.002
P6.5 retinaATTGTTTATG (4)405.20.4052
P6.5 retinaGTTAAGATTT (4)6.70.0067
P6.5 retinaGAGGGACTTG (6)1.70.0017
P6.5 retinaGCTTTGGCTT (7)1.70.0017
P6.5 retinaTCCCTGGCTG (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaATTGTTTATG (4)159.80.1598
P10.5 crx- retinaGAGGGACTTG (6)5.60.0056
P10.5 crx- retinaGTTAAGATTT (4)5.60.0056
P10.5 crx- retinaGCTTTGGCTT (7)3.70.0037
P10.5 crx+ retinaATTGTTTATG (4)151.90.1519
P10.5 crx+ retinaGAGGGACTTG (6)3.80.0038
Adult retinalATTGTTTATG (4)35.20.0352
ONLATTGTTTATG (4)99.60.0996
ONLGTTAAGATTT (4)1.90.0019
ONLTCCCTGGCTG (5)1.90.0019