Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.287267 4933430H15RikRIKEN cDNA 4933430H15 gene 3    74485 
 Mm.287267 Arhgef11Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11 3    213498 
 Gene Ontology guanyl-nucleotide exchange factor activity
 Human Homolog ARHGEF11[Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 55 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GTTAAGATTT (2)
TCCCTGGCTG
159.90.1599
Cb medulloblastomaATTGTTTATG (3)
GCTTTGGCTT (2)
GTTAAGATTT (2)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureATTGTTTATG (3)
GTTAAGATTT (2)
78.70.0787
P8 GC+SHH+1d cultureATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GCTTTGGCTT (2)
186.10.1861
3T3 fibroblastsATTGTTTATG (3)
GCTTTGGCTT (2)
17.50.0175
E15 cortexATTGTTTATG (3)
GCTTTGGCTT (2)
19.80.0198
P1 cortexATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GTTAAGATTT (2)
31.70.0317
HypothalamusATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GTTAAGATTT (2)
21.70.0217
E12.5 retinaATTGTTTATG (3)
159.60.1596
E14.5 retinaATTGTTTATG (3)
GTTAAGATTT (2)
244.10.2441
E16.5 retinaATTGTTTATG (3)
GCTTTGGCTT (2)
GTTAAGATTT (2)
173.80.1738
E18.5 retinaATTGTTTATG (3)
GTTAAGATTT (2)
358.40.3584
P0.5 retinaATTGTTTATG (3)
GCTTTGGCTT (2)
GTTAAGATTT (2)
192.30.1923
P2.5 retinaATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GTTAAGATTT (2)
330.90.3309
P4.5 retinaATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GTTAAGATTT (2)
TCCCTGGCTG
416.10.4161
P6.5 retinaATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GCTTTGGCTT (2)
GTTAAGATTT (2)
TCCCTGGCTG
4170.417
P10.5 crx- retinaATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
GCTTTGGCTT (2)
GTTAAGATTT (2)
174.70.1747
P10.5 crx+ retinaATTGTTTATG (3)
GAGGGACTTG (3)
155.70.1557
Adult retinalATTGTTTATG (3)
35.20.0352
ONLATTGTTTATG (3)
GTTAAGATTT (2)
TCCCTGGCTG
103.40.1034