Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.288733 2810442O16RikRIKEN cDNA 2810442O16 gene 2    67231 
 Gene Ontology integral to membrane
 Human Homolog C20orf140[chromosome 20 open reading frame 140]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 148 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAATAAACC (5)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GCTGCCAGCA (3)
GCTGGACAGC (4)
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
22.80.0228
Cb medulloblastomaCAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTTCCTC (2)
GCTGCCAGCA (3)
GCTGCCCAGC
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
39.20.0392
P8 GC+1d cultureAGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCCC
CCCTTCCCTT
GAAGCAAAAG
GCAGGAGGAT
GCTGCCCAGC
GCTGGACAGC (4)
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
38.60.0386
P8 GC+SHH+1d cultureAGCTCAGGGT (2)
CAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GCTGCCAGCA (3)
GTTGCTGCGG
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
43.40.0434
3T3 fibroblastsAGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
280.028
E15 cortexAGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GCTGCCAGCA (3)
49.40.0494
P1 cortexCCCTTCCCTT
18.20.0182
HypothalamusAGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GAAGCAAAAG
GCTGCCAGCA (3)
TGCAGAGGAA (3)
34.30.0343
E12.5 retinaAAAATAAACC (5)
CAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GCAGGAGGAT
GCTGCCCAGC
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
37.70.0377
E14.5 retinaACAAAACCTA
ACCTTCCCTC
AGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCCC
CCCTTCCCTT
GAAGCAAAAG
GCAGGAGGAT
GCTGCCAGCA (3)
GCTGCCCAGC
GGCTTCCCTC (3)
GTGGATGATT
GTTGCTGCGG
TGACTCGTGA
81.60.0816
E16.5 retinaAGCTCAGGGT (2)
CAGAGTTGCT (2)
CCCTTCCCTC (2)
CCCTTCCCTT
GCTGCCAGCA (3)
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
79.70.0797
E18.5 retinaAAAATAAACC (5)
AGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTC (2)
CCCTTCCCTT
GCTGCCAGCA (3)
GTGGATGATT
TGCAGAGGAA (3)
39.90.0399
P0.5 retinaAGCTCAGGGT (2)
CAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GAAGCAAAAG
GCTGCCAGCA (3)
GCTGGACAGC (4)
TAACTGTGCC (3)
TGCAGAGGAA (3)
64.90.0649
P2.5 retinaAGCTCAGGGT (2)
CAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCCC
CCCTTCCCTT
CCCTTTCCTC (2)
GCAGGAGGAT
GCTGCCAGCA (3)
GCTGCCCAGC
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
44.10.0441
P4.5 retinaACCTTCCCTC
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
CCCTTTCCTC (2)
GCTGCCAGCA (3)
GGCTTCCCTC (3)
TAACTGTGCC (3)
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
33.70.0337
P6.5 retinaACCTTCCCTC
AGCTCAGGGT (2)
CAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GAAGCAAAAG
GCTGCCAGCA (3)
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
48.40.0484
P10.5 crx- retinaAGCTCAGGGT (2)
CAGAGTTGCT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GCTGCCAGCA (3)
TGCAGAGGAA (3)
50.30.0503
P10.5 crx+ retinaAGCTCAGGGT (2)
CAGAGTGCTG (2)
CAGAGTTGCT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTT
GAAGCAAAAG
GCTGCCAGCA (3)
GCTGCCCAGC
TGCAGAGGAA (3)
42.20.0422
Adult retinalAGCTCAGGGT (2)
CCCTGCCCTG (4)
CCCTTCCCTC (2)
CCCTTCCCTT
GGCTTCCCTC (3)
GTTGCTGCGG
TGACTCGTGA
TGCAGAGGAA (3)
33.60.0336
ONLCAGAGTGCTG (2)
CCCTGCCCTG (4)
GTGGATGATT
TGCAGAGGAA (3)
15.20.0152