Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.289662 Ddx3xDEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 3, X-linked X  1 7.0 cM  13205 
 Mm.289662 Fin14fibroblast growth factor inducible 14 X  6 42.0 cM  14209 
 Gene Ontology integral to membrane
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 107 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGCTGTGCAT (3)37.50.0375
P8 Cb GCCTAGTGTTGA (3)9.80.0098
P8 Cb GCTTTGAGGATT (4)6.50.0065
P8 Cb GCTGGCAGTGGA (4)3.30.0033
P8 Cb GCACTGGAATGG (7)1.60.0016
P8 Cb GCGCCCCAAATG (4)1.60.0016
P8 Cb GCGTATTTATAG (3)1.60.0016
P8 Cb GCTAACTTAGCC (2)1.60.0016
P8 Cb GCTGGTTATCTT (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGCTGTGCAT (3)16.20.0162
Cb medulloblastomaCTAGTGTTGA (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaGGAATGATAG (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaGTATTTATAG (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGGCAGTGGA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTGAGGATT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGCTGTGCAT (3)20.50.0205
P8 GC+1d cultureACTGGAATGG (7)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGGAATGATAG (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGTATTTATAG (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGCTGTGCAT (3)31.60.0316
P8 GC+SHH+1d cultureTTTGAGGATT (4)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureTAACTTAGCC (2)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureACTGGAATGG (7)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTATTTATAG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTGTGTTGA (5)1.20.0012
3T3 fibroblastsGTCATAGCTG (590)10.50.0105
3T3 fibroblastsTGCTGTGCAT (3)10.50.0105
3T3 fibroblastsCACCAGGCAC (2)3.50.0035
3T3 fibroblastsCTAGTGTTGA (3)3.50.0035
3T3 fibroblastsGCCCCAAATG (4)3.50.0035
E15 cortexCTAGTGTTGA (3)4.90.0049
E15 cortexGTCATAGCTG (590)4.90.0049
E15 cortexTGCTGTGCAT (3)4.90.0049
P1 cortexCTAGTGTTGA (3)18.20.0182
P1 cortexACTGGAATGG (7)9.10.0091
P1 cortexTGCTGTGCAT (3)9.10.0091
HypothalamusTGCTGTGCAT (3)19.90.0199
HypothalamusTGGCAGTGGA (4)3.60.0036
HypothalamusTAACTTAGCC (2)1.80.0018
HypothalamusTTTGAGGATT (4)1.80.0018
E12.5 retinaTGCTGTGCAT (3)50.70.0507
E12.5 retinaTAACTTAGCC (2)3.80.0038
E12.5 retinaCTAGTGTTGA (3)1.90.0019
E12.5 retinaTTTGTGTTGA (5)1.90.0019
E14.5 retinaTGCTGTGCAT (3)200.02
E14.5 retinaCTAGTGTTGA (3)5.50.0055
E14.5 retinaGTCTCAAAGT (5)3.60.0036
E14.5 retinaTGGTTATCTT (2)3.60.0036
E14.5 retinaTTTGAGGATT (4)3.60.0036
E16.5 retinaTGCTGTGCAT (3)39.80.0398
E16.5 retinaGTCTCAAAGT (5)7.20.0072
E16.5 retinaTTTGAGGATT (4)3.60.0036
E16.5 retinaCTAGTGTTGA (3)1.80.0018
E16.5 retinaGCCCCAAATG (4)1.80.0018
E16.5 retinaTGGTTATCTT (2)1.80.0018
E18.5 retinaTGCTGTGCAT (3)14.60.0146
E18.5 retinaGTATTTATAG (3)3.60.0036
E18.5 retinaTTTGAGGATT (4)3.60.0036
E18.5 retinaCTAGTGTTGA (3)1.80.0018
P0.5 retinaTGCTGTGCAT (3)25.50.0255
P0.5 retinaCTAGTGTTGA (3)5.90.0059
P0.5 retinaGTCATAGCTG (590)3.90.0039
P0.5 retinaTGGCAGTGGA (4)3.90.0039
P0.5 retinaCACCAGGCAC (2)20.002
P0.5 retinaTAACTTAGCC (2)20.002
P2.5 retinaTGCTGTGCAT (3)510.051
P2.5 retinaTTTGAGGATT (4)5.30.0053
P2.5 retinaCTAGTGTTGA (3)3.50.0035
P2.5 retinaGTATTTATAG (3)3.50.0035
P2.5 retinaGTCATAGCTG (590)1.80.0018
P2.5 retinaTAACTTAGCC (2)1.80.0018
P2.5 retinaTGGCAGTGGA (4)1.80.0018
P4.5 retinaTGCTGTGCAT (3)21.80.0218
P4.5 retinaCTAGTGTTGA (3)40.004
P4.5 retinaGTATTTATAG (3)20.002
P4.5 retinaGTCATAGCTG (590)20.002
P4.5 retinaTGGCAGTGGA (4)20.002
P6.5 retinaTGCTGTGCAT (3)41.70.0417
P6.5 retinaCTAGTGTTGA (3)50.005
P6.5 retinaACTGGAATGG (7)3.30.0033
P6.5 retinaGTCATAGCTG (590)3.30.0033
P6.5 retinaTTTGAGGATT (4)3.30.0033
P6.5 retinaGTATTTATAG (3)1.70.0017
P6.5 retinaTAACTTAGCC (2)1.70.0017
P6.5 retinaTGGCAGTGGA (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGCTGTGCAT (3)14.90.0149
P10.5 crx- retinaTTTGAGGATT (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTAACTTAGCC (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGGCAGTGGA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGCTGTGCAT (3)48.10.0481
P10.5 crx+ retinaCACCAGGCAC (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTAGTGTTGA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTATTTATAG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTAACTTAGCC (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTTGAGGATT (4)1.90.0019
Adult retinalTGCTGTGCAT (3)16.70.0167
Adult retinalACTGGAATGG (7)1.90.0019
Adult retinalCACCAGGCAC (2)1.90.0019
Adult retinalGCCCCAAATG (4)1.90.0019
Adult retinalGTCATAGCTG (590)1.90.0019
Adult retinalTAACTTAGCC (2)1.90.0019
Adult retinalTGGTTATCTT (2)1.90.0019
ONLTGCTGTGCAT (3)21.10.0211
ONLGTCATAGCTG (590)5.70.0057
ONLGGAATGATAG (3)1.90.0019
ONLTTTGAGGATT (4)1.90.0019
ONLTTTGTGTTGA (5)1.90.0019