Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.289900	Cct7	chaperonin subunit 7 (eta)	6		12468
Gene Ontology	ATP binding | protein folding
Human Homolog	CCT7[chaperonin containing TCP1, subunit 7 (eta)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 109 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TATACTTGGA 6.5 0.0065 P8 Cb GC CTCAACAAGC (5) 4.9 0.0049 P8 Cb GC ATGCTAGAGG (4) 3.3 0.0033 P8 Cb GC CCTTATTGTG (3) 3.3 0.0033 P8 Cb GC AGGGTGGATG (2) 1.6 0.0016 P8 Cb GC GCTGCCGTAG (3) 1.6 0.0016 P8 Cb GC GCTGGCTCCC (2) 1.6 0.0016 P8 Cb GC GGGGCCCTGG (11) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TGACCCTTGC (6) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TTCTGTGCTG (4) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma CTCAACAAGC (5) 4.6 0.0046 Cb medulloblastoma CCTTATTGTG (3) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma GAGGATTCCA (4) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma GCTGGCTCCC (2) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma GGGGCCCTGG (11) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma TATGTATTCT (5) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma TGACCCTTGC (6) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture CCTTATTGTG (3) 5.7 0.0057 P8 GC+1d culture TATACTTGGA 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture TATGTATTCT (5) 3.4 0.0034 P8 GC+1d culture ATGCTAGAGG (4) 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture CCTTATTGTG (3) 8.2 0.0082 P8 GC+SHH+1d culture GCTGGCTCCC (2) 3.5 0.0035 P8 GC+SHH+1d culture ATGCTAGAGG (4) 2.3 0.0023 P8 GC+SHH+1d culture TATACTTGGA 2.3 0.0023 P8 GC+SHH+1d culture TTCTGTGCTG (4) 2.3 0.0023 P8 GC+SHH+1d culture TATGTATTCT (5) 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture TGACCCTTGC (6) 1.2 0.0012 3T3 fibroblasts CCTTATTGTG (3) 3.5 0.0035 3T3 fibroblasts CTCAACAAGC (5) 3.5 0.0035 3T3 fibroblasts TGACCCTTGC (6) 3.5 0.0035 E15 cortex AGGGTGGATG (2) 4.9 0.0049 E15 cortex ATGCTAGAGG (4) 4.9 0.0049 E15 cortex GCGTCTGGGA (3) 4.9 0.0049 E15 cortex GCTGCCGTAG (3) 4.9 0.0049 E15 cortex GGGGAGCCCT 4.9 0.0049 E15 cortex TATACTTGGA 4.9 0.0049 E15 cortex TTCTGTGCTG (4) 4.9 0.0049 P1 cortex CCTTATTGTG (3) 9.1 0.0091 P1 cortex GAGGATTCCA (4) 4.5 0.0045 P1 cortex GCTGCCGTAG (3) 4.5 0.0045 P1 cortex TATGTATTCT (5) 4.5 0.0045 Hypothalamus CTCAACAAGC (5) 3.6 0.0036 Hypothalamus GCTGGCTCCC (2) 3.6 0.0036 Hypothalamus TATACTTGGA 3.6 0.0036 Hypothalamus CCTTATTGTG (3) 1.8 0.0018 Hypothalamus GCGTCTGGGA (3) 1.8 0.0018 Hypothalamus GGGGCCCTGG (11) 1.8 0.0018 Hypothalamus TATGTATTCT (5) 1.8 0.0018 Hypothalamus TGACCCTTGC (6) 1.8 0.0018 E12.5 retina CCTTATTGTG (3) 11.3 0.0113 E12.5 retina ATGCTAGAGG (4) 3.8 0.0038 E14.5 retina ATTGTGAGGA 3.6 0.0036 E14.5 retina CCTTATTGTG (3) 3.6 0.0036 E14.5 retina GCTGGCTCCC (2) 3.6 0.0036 E14.5 retina ATGCTAGAGG (4) 1.8 0.0018 E14.5 retina CTCAACAAGC (5) 1.8 0.0018 E14.5 retina GAGGATTCCA (4) 1.8 0.0018 E14.5 retina GGGGCCCTGG (11) 1.8 0.0018 E14.5 retina TATGTATTCT (5) 1.8 0.0018 E16.5 retina CCTTATTGTG (3) 5.4 0.0054 E16.5 retina ATGCTAGAGG (4) 3.6 0.0036 E16.5 retina CCTTATTGTT (6) 1.8 0.0018 E16.5 retina CTCAACAAGC (5) 1.8 0.0018 E16.5 retina TGACCCTTGC (6) 1.8 0.0018 E16.5 retina TTCTGTGCTG (4) 1.8 0.0018 E18.5 retina ATGCTAGAGG (4) 5.5 0.0055 E18.5 retina CCTTATTGTG (3) 5.5 0.0055 E18.5 retina TATGTATTCT (5) 5.5 0.0055 E18.5 retina GCTGCCGTAG (3) 1.8 0.0018 E18.5 retina GCTGGCTCCC (2) 1.8 0.0018 E18.5 retina TTCTGTGCTG (4) 1.8 0.0018 P0.5 retina CCTTATTGTG (3) 13.7 0.0137 P0.5 retina ATGCTAGAGG (4) 2 0.002 P0.5 retina CCTTATTGTT (6) 2 0.002 P0.5 retina CTCAACAAGC (5) 2 0.002 P2.5 retina ATGCTAGAGG (4) 1.8 0.0018 P2.5 retina CCTTATTGTG (3) 1.8 0.0018 P2.5 retina TATACTTGGA 1.8 0.0018 P4.5 retina CCTTATTGTG (3) 5.9 0.0059 P4.5 retina CTCAACAAGC (5) 2 0.002 P4.5 retina GCGTCTGGGA (3) 2 0.002 P4.5 retina GCTGGCTCCC (2) 2 0.002 P4.5 retina GGGGCCCTGG (11) 2 0.002 P4.5 retina TATGTATTCT (5) 2 0.002 P6.5 retina CCTTATTGTG (3) 6.7 0.0067 P6.5 retina ATGCTAGAGG (4) 3.3 0.0033 P6.5 retina TATGTATTCT (5) 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina CCTTATTGTG (3) 7.4 0.0074 P10.5 crx- retina ATGCTAGAGG (4) 3.7 0.0037 P10.5 crx- retina AGGGTGGATG (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina CTCAACAAGC (5) 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina GCTGGCTCCC (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina TATGTATTCT (5) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina ATGCTAGAGG (4) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina CCTTATTGTG (3) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina ATTGTGAGGA 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina GGGGCCCTGG (11) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TATGTATTCT (5) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TTCTGTGCTG (4) 1.9 0.0019 Adult retinal CCTTATTGTG (3) 11.1 0.0111 Adult retinal ATGCTAGAGG (4) 5.6 0.0056 Adult retinal GGGGAGCCCT 3.7 0.0037 Adult retinal TATGTATTCT (5) 3.7 0.0037 Adult retinal CCTTATTGTT (6) 1.9 0.0019 Adult retinal GGGGCCCTGG (11) 1.9 0.0019 ONL CCTTATTGTG (3) 11.5 0.0115 ONL ATGCTAGAGG (4) 5.7 0.0057 ONL CTCAACAAGC (5) 1.9 0.0019