Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.289936	Psat1	phosphoserine aminotransferase 1	19	19 32.5 cM	107272
Mm.289936	AL024083	expressed sequence AL024083	19		404582
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 65 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACAACCAGA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) 19.5 0.0195 Cb medulloblastoma ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGACCCCGGG (2) TGACCTGGGA (4) 13.8 0.0138 P8 GC+1d culture GAAAACATTA (5) GGACCCCGGG (2) GGCTGAACAA (2) TGACCTGGGA (4) 11.3 0.0113 P8 GC+SHH+1d culture GAAAACATTA (5) GGAAGCCACC (2) GGACCCCGGG (2) GGCTGAACAA (2) 22.3 0.0223 3T3 fibroblasts TGACCTGGAA (2) TGACCTGGGA (4) 14 0.014 P1 cortex CTTATTACAG (3) 4.5 0.0045 Hypothalamus GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) TGACCTGGGA (4) 30.7 0.0307 E12.5 retina GAAAACATTA (5) GGACCCCGGG (2) 16.9 0.0169 E14.5 retina GAAAACATTA (5) GGACCCCGGG (2) TCCCTCAACT (4) 10.9 0.0109 E16.5 retina AACAACCAGA (2) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) GGCTGAACAA (2) TCCCTCAACT (4) 23.5 0.0235 E18.5 retina AACAACCAGA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GGAAGCCACC (2) GGACCCCGGG (2) 16.3 0.0163 P0.5 retina GAAAACATTA (5) GGAAGCCACC (2) 7.9 0.0079 P2.5 retina ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GGAAGCCACC (2) GGACCCCGGG (2) TCCCTCAACT (4) TGACCTGGGA (4) 28.4 0.0284 P4.5 retina ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) TGACCTGGGA (4) 19.9 0.0199 P6.5 retina GAAAACATTA (5) 13.3 0.0133 P10.5 crx- retina GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) TGACCTGGGA (4) 13 0.013 P10.5 crx+ retina AACAACCAGA (2) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) TGACCTGGGA (4) 15.3 0.0153 Adult retinal TCCCTCAACT (4) TGACCTGGAA (2) TGACCTGGGA (4) 5.7 0.0057 ONL TGACCTGGGA (4) 3.8 0.0038