Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.29044 B230110O18RikRIKEN cDNA B230110O18 gene 14    77844 
 Mm.29044 AI448102expressed sequence AI448102 14    328419 
 Mm.29044 5033406L14RikRIKEN cDNA 5033406L14 gene 14    75965 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 69 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTATTAAATA (4)8.20.0082
P8 Cb GCTACAAATGTA (5)1.60.0016
P8 Cb GCTGACAGATGT (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaTTTAAAAAAA (34)6.90.0069
Cb medulloblastomaTGCACTATGG (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTACAAATGTA (5)320.032
P8 GC+1d cultureCTATTAAATA (4)14.80.0148
P8 GC+1d cultureTGACAGATGT (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGCACTATGG (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTACAAATGTA (5)17.60.0176
P8 GC+SHH+1d cultureCTATTAAATA (4)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureTTTAAAAAAA (34)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureATTACAGACA (6)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTAGGAAACA (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGCACTATGG (3)70.007
E15 cortexCTATTAAATA (4)4.90.0049
P1 cortexCTATTAAATA (4)9.10.0091
HypothalamusCTATTAAATA (4)10.90.0109
HypothalamusTTTAAAAAAA (34)10.90.0109
HypothalamusTGCACTATGG (3)5.40.0054
HypothalamusTACAAATATG (4)1.80.0018
E12.5 retinaCTATTAAATA (4)150.015
E12.5 retinaGGATTTGGGG (4)1.90.0019
E12.5 retinaTGACAGATGT (5)1.90.0019
E12.5 retinaTTTAAAAAAA (34)1.90.0019
E14.5 retinaCTATTAAATA (4)23.70.0237
E14.5 retinaTTTAAAAAAA (34)9.10.0091
E14.5 retinaTGACAGATGT (5)3.60.0036
E16.5 retinaCTATTAAATA (4)18.10.0181
E16.5 retinaTATAAATATT (8)1.80.0018
E16.5 retinaTTTAAAAAAA (34)1.80.0018
E18.5 retinaCTATTAAATA (4)21.80.0218
E18.5 retinaTTTAAAAAAA (34)10.90.0109
E18.5 retinaGGATTTGGGG (4)1.80.0018
E18.5 retinaTGACAGATGT (5)1.80.0018
P0.5 retinaCTATTAAATA (4)9.80.0098
P0.5 retinaTGCACTATGG (3)3.90.0039
P0.5 retinaATTACAGACA (6)20.002
P0.5 retinaGTAGGAAACA (3)20.002
P0.5 retinaTGACAGATGT (5)20.002
P0.5 retinaTTTAAAAAAA (34)20.002
P2.5 retinaCTATTAAATA (4)15.80.0158
P2.5 retinaGTAGGAAACA (3)1.80.0018
P2.5 retinaTGACAGATGT (5)1.80.0018
P2.5 retinaTTTAAAAAAA (34)1.80.0018
P4.5 retinaCTATTAAATA (4)21.80.0218
P4.5 retinaTTTAAAAAAA (34)5.90.0059
P4.5 retinaATTACAGACA (6)20.002
P4.5 retinaTATAAATATT (8)20.002
P6.5 retinaCTATTAAATA (4)13.30.0133
P6.5 retinaTACAAATATG (4)6.70.0067
P6.5 retinaTTTAAAAAAA (34)6.70.0067
P6.5 retinaATTACAGACA (6)1.70.0017
P6.5 retinaTACAAATGTA (5)1.70.0017
P6.5 retinaTGACAGATGT (5)1.70.0017
P6.5 retinaTGCACTATGG (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCTATTAAATA (4)130.013
P10.5 crx- retinaTACAAATATG (4)9.30.0093
P10.5 crx- retinaATTACAGACA (6)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTACAAATGTA (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTATAAATATT (8)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTATTAAATA (4)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaTACAAATATG (4)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaTGACAGATGT (5)1.90.0019
Adult retinalCTATTAAATA (4)1.90.0019
Adult retinalTACAAATGTA (5)1.90.0019
Adult retinalTGCACTATGG (3)1.90.0019
ONLTTTAAAAAAA (34)7.70.0077
ONLCTATTAAATA (4)5.70.0057