Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.290692	Tkt	transketolase	14		21881
Gene Ontology	calcium ion binding | fertilization (sensu Animalia) | regulation of growth | transferase activity | transketolase activity | transketolase activity
Human Homolog	TKT[transketolase (Wernicke-Korsakoff syndrome)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 158 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) AGGCCTTGGC (2) GCCGAGCAGA GGATGCTGGG GGCCTTGCTG (2) GGCTTTGCTG (4) GTGTGTGGTG (3) TGCAAGCTGT 97.7 0.0977 Cb medulloblastoma AAAGGAAAAA (2) AGGCCTGGCT (4) AGGCCTTGGC (2) GAGGTTCTGG (2) GCCGAGCAGA GCCTCTGCTG (2) GCTGTTGCTG (2) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GGCTTTGGTT GTGTGTGGTG (3) 71.6 0.0716 P8 GC+1d culture AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) GCCGAGCAGA GCCTCTGCTG (2) GCCTTTGCTT GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GGCTTTGCTG (4) GTGTGTGGTG (3) TGCGAGCAGA 63.8 0.0638 P8 GC+SHH+1d culture AAAGGAAAAA (2) AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) GAGGTTCTGG (2) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) TGCAAGCTGT TGCGAGCAGA 94.9 0.0949 3T3 fibroblasts AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) TGCAAGCTGT TGCCTTTGCT (2) TGCGAGCAGA 73.5 0.0735 E15 cortex AAAGGAAAAA (2) AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) 123.5 0.1235 P1 cortex AGGCCTGGCT (4) GCCTCTGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) TGCCTTTGCT (2) 40.8 0.0408 Hypothalamus AAAGGAAAAA (2) AGGCCTTGGC (2) CAGCTCCCAA GCCGAGCAGA GCCTCTGCTG (2) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) 32.4 0.0324 E12.5 retina AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) 69.6 0.0696 E14.5 retina AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) 41.8 0.0418 E16.5 retina AAAGGAAAAA (2) AGGAAGATCA AGGCCTTGGC (2) CAGCTCCCAA GCCGAGCAGA GGATGCTGGG GGCTTTGCTG (4) GTGTGTGGTG (3) TCCACCGTCT 54.2 0.0542 E18.5 retina AAAGGAAAAA (2) AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) CAGCTCCCAA GAGGTTCTGG (2) GCCTCTGCTG (2) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) TGCAAGCTGT 79.9 0.0799 P0.5 retina AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) AGGCCTTGGC (2) CAGCTCCCAA GCCGAGCAGA GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) TCCACCGTCT TGCCTTTGCT (2) 76.8 0.0768 P2.5 retina AGGAAGATCA AGGCCTGGCT (4) CAGCTCCCAA GCCGAGCAGA GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) 82.6 0.0826 P4.5 retina AAAGGAAAAA (2) AGGAAGATCA CAGCTCCCAA GCCTTTGCTT GGATGCTGGG GTGTGTGGTG (3) TGCCTTTGCT (2) 59.6 0.0596 P6.5 retina AGGCCTGGCT (4) CAGCTCCCAA GAGGTTCTGG (2) GCCTCTGCTG (2) GCTGTTGCTG (2) GGATGCTGGG GGCCTTGCTG (2) GTGTGTGGTG (3) 35.2 0.0352 P10.5 crx- retina CAGCTCCCAA GCCTCTGCTG (2) GCTGTTGCTG (2) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GGCTTTGGTT GTGTGTGGTG (3) 57.7 0.0577 P10.5 crx+ retina AAAGGAAAAA (2) AGGCCTGGCT (4) AGGCCTTGGC (2) CAGCTCCCAA GCCGAGCAGA GCCTCTGCTG (2) GCCTTTGCTT GGATGCTGGG GGCTTTGGTT GTGTGTGGTG (3) TGCAAGCTGT 86.2 0.0862 Adult retinal AGGCCTTGGC (2) CAGCTCCCAA GCCGAGCAGA GCCTCTGCTG (2) GCTGTTGCTG (2) GCTTTGGCTG (2) GGATGCTGGG GGCCTTGCTG (2) GGCTTTGCTG (4) GTGTGTGGTG (3) 67 0.067 ONL CAGCTCCCAA GGATGCTGGG GGCTTTGGTT GTGTGTGGTG (3) TCCACCGTCT 22.9 0.0229