Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.297	Actb	actin, beta, cytoplasmic	5	5 80.0 cM	11461
Gene Ontology	actin cytoskeleton | actin filament | cytoskeleton | cytoskeleton organization and biogenesis | motor activity | structural constituent of cytoskeleton | structural molecule activity
Human Homolog	ACTB[actin, beta]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 410 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAATAAGTGG (3) AAATGGTGAC AACATAATTA AAGATCAAGA (2) AAGATCAAGG (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) AATCAATATG AGACTGTACT AGATCTGACG AGCTGCTGGA (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGCTCCAGA (3) GACAAGATCT GACGCGACCA GAGAAAAGAT (2) GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATACTTGGG (2) GATGCCACAG (4) GATGCCACCA (3) GCTTTGTTTT (2) GTGCTAGGAA GTGCTAGGAG (2) GTGCTTGGAA GTGGTACACA (3) GTGGTACCAG TACCCAGGCA (2) TACGTAGCCA TGCAAAGCCG (2) TTTGAGACCT (2) 430.5 0.4305 Cb medulloblastoma AAAACTACAT (3) AAATAAGTGG (3) AAATCTGCCC (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGATCCTGG (2) AATCAATATG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATGCCACCA (3) GCTTTGTTTT (2) GTGGTACAGG GTGGTACCGC GTGTTAGGAG TCCTCCAAGG (2) 117.8 0.1178 P8 GC+1d culture AAATAAGTGG (3) AAATCTGCCC (3) AAGATCAAGA (2) AGACTGTACT AGATCTGACG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACAAGATCT GACGCGACCA GAGAAAAGAT (2) GATACTTGGA GATACTTGGG (2) GCCCCTGCAT GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GTGGTACAGG GTGGTACCAG GTGGTGCCAG TACATAACCA TACCCAGGCA (2) TCCTCCAAGG (2) 270.1 0.2701 P8 GC+SHH+1d culture AAATAAGTGG (3) AAATCTGCCC (3) AACATAATTA AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AGATCTGACG AGCCTGGCGG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GAGAAAAGAT (2) GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATACTTGGG (2) GCCGATCCTC (3) GCTCCCTCCT (3) GCTTTGTTTT (2) GTGGTACCAG GTGGTGCCAG TACATAACCA TTTGAGAGCT 290.6 0.2906 3T3 fibroblasts AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATGCCACCA (3) GCCACCTGCC GCCGATCCTC (3) GCTCCCTCCT (3) GCTTTGTTTT (2) GGGAAAGCCC (2) GTGGTACCAG GTGGTGCCAG TCCTCCAAGG (2) TGTACTGTAT 669.3 0.6693 E15 cortex AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCAAGG (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) AGATCTGACG AGCCTGGCGG AGTGTGACGT (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GCCAAGATCT GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GGGAAAGCCC (2) TACCCAGGCA (2) 528.9 0.5289 P1 cortex AAGATCAAGA (2) AAGATCAAGG (2) AGCCTGGCGG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GATACTTGGA GATACTTGGG (2) GATGCCACCA (3) GCCAAGATCT GCTTTGTTTT (2) GTGCTTGGAA GTGGTACCAG TACATAACCA TGTACTGTAT 890.5 0.8905 Hypothalamus AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGATCCTGG (2) AGACTGTACT AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGCTCCAGA (3) GACGCGACCA GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATGCCACAG (4) GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GTGGTACACA (3) GTGTTAGGAG TAACCCAGGC 57.7 0.0577 E12.5 retina AAGATCAAGA (2) AAGATCAAGG (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GATACTTGGA GATGCCACCA (3) GCCCCTGCAT GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGGAAGATTT (3) GTGGTACACA (3) GTGGTACCAG GTGTTAGGAG TACGTAGCCA 272.5 0.2725 E14.5 retina AAATAAGTGG (3) AAATGGTGAC AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGATCCTGG (2) AAGTGTGACG (3) AGCCTGGCGG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACAAGATCT GACGCGACCA GATACTTGGA GCCAAGATCT GCCCCTGCAT GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GGGAAGATTT (3) GTGGTACACA (3) GTGGTACAGG GTGGTGGGAG (2) TACATAACCA TACCCAGGCA (2) TACGTAGCCA TGTGAGACCC 103.5 0.1035 E16.5 retina AAATAAGTGG (3) AAATGGTGAC AAGACCAAAA (2) AAGATCAAGA (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACAAGATCT GACGCGACCA GATACTTGGA GCCAAGATCT GCCCCTGCAT GCTTTGTTTT (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAG (2) GTGCTGGGAA GTGGTACCAG TACATAACCA TACCCAGGCA (2) TACGTAGCCA TTACCAGGCA (2) 104.9 0.1049 E18.5 retina AAATAAGTGG (3) AAATGGTGAC AAGACCAAAA (2) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGG (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACAAGATCT GACGCGACCA GATACTTGGA GATACTTGGG (2) GCTTTGTTTT (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTTGGAA GTGGTACCAG TACATAACCA TACCCAGGCA (2) TTTGAGAGCT 128.9 0.1289 P0.5 retina AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGGTCTCTC (2) GACGCGACCA GATACTTGGA GATGCCACCA (3) GCCGATCCTC (3) GCTCCCTCCT (3) GCTTTGTTTT (2) GGGAAGATTT (3) GTGGTACCAG TACATAACCA TACCCAGGCA (2) TCCTCCAAGG (2) TGTACTGTAT 182.6 0.1826 P2.5 retina AAAGATCCCT (3) AAATCTGCCC (3) AAGACCAAAA (2) AAGATCAAGA (2) AGCCTGGCGG AGCTGCTGGA (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GATACTTGGA GCCAAGATCT GCCCCTGCAT GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAA GTGCTAGGAG (2) GTGGTACCAG TACATAACCA TCCTCCAAGG (2) TTACCAGGCA (2) 180 0.18 P4.5 retina AAGACCAAAA (2) AAGATCAAGA (2) AGCCTGGCGG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGGTCTCTC (2) GACGCGACCA GATACTTGGA GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGGAAAGCCC (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAG (2) TACATAACCA TGTGAGACCC TTTGAGAGCT 136.9 0.1369 P6.5 retina AAATCTGCCC (3) AAGACCAAAA (2) AAGATCAAGA (2) AATCAATATG AGCCTGGCGG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GACGCGACCA GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATACTTGGG (2) GATGCCACAG (4) GCCACCTGCC GCCGATCCTC (3) GCTCCCTCCT (3) GCTTTGTTTT (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAG (2) GTGCTGGGAA GTGGTACCAG TACCCAGGCA (2) TCCTCCAAGG (2) TGTACTGTAT TTACCAGGCA (2) 181.9 0.1819 P10.5 crx- retina AAAGATCCCT (3) AAATCTGCCC (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGG (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC GATACTTGGA GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAG (2) GTGCTTGGAA GTGGTACCAG TAACCCAGGC TACATAACCA TTTGAGAGCT 97 0.097 P10.5 crx+ retina AAATCTGCCC (3) AAGATCAAGA (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGCTCCAGA (3) GACGCGACCA GAGAAGATCT (2) GATACTTGGA GATGCCACCA (3) GCCAAGATCT GCCGATCCTC (3) GCTCCCTCCT (3) GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAG (2) GTGGTGGGAG (2) TACCCAGGCA (2) TCCTCCAAGG (2) 120.8 0.1208 Adult retinal AAAACTACAT (3) AAAGATCCCT (3) AAATCTGCCC (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGG (2) AATCAATATG AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGGTCTCTC (2) GAGAAAAGAT (2) GATACTTGGA GCCACCTGCC GCCCCTGCAT GCTTTGTTTT (2) GGCAGGGGTG (2) GGGAAGATTT (3) GTGCTAGGAA GTGCTAGGAG (2) GTGGTGGGAG (2) TACATAACCA TCCTCCAAGG (2) TTTGAGACCT (2) 117.4 0.1174 ONL AAATCTGCCC (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGG (2) AGCTGCTGGA (2) AGTGTGACGT (2) CCCCCACCCC (2) CCCTGAGTCC CTGGTCTCTC (2) GATACTTGGA GCCACCTGCC GCCGATCCTC (3) GCTTTGTTTT (2) GTGCTAGGAG (2) GTGCTGGGAA GTGGTACACA (3) GTGGTACAGG GTGGTACCGC GTGTTAGGAG TGTGAGACCC 104.9 0.1049