Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.30012 BB136667expressed sequence BB136667 1    98743 
 Mm.30012 Hdlbphigh density lipoprotein (HDL) binding protein 1  1 55.3 cM  110611 
 Gene Ontology cholesterol metabolism | lipid transport | lipid transporter activity | nucleic acid binding | nucleus | RNA binding
 Human Homolog HDLBP[high density lipoprotein binding protein (vigilin)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 106 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGCCCTGC (2)
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
GAGGGAATCC
19.60.0196
Cb medulloblastomaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
GAAAATGAGA
GCTTCAAAAA
18.40.0184
P8 GC+1d cultureAAGTCAACGT
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAGGAATGTG (3)
GAGGGAATCC
GCTTCAAAAA
GGGCCCAAGC (3)
GGGGCGCACA
TATTCAGCAC (2)
260.026
P8 GC+SHH+1d cultureAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
15.30.0153
3T3 fibroblastsACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
CAGGAGACAG (2)
GAAAATGAGA
101.60.1016
E15 cortexCAGGAGACCG
GAAAATGAGA
TAGTCAGCAC (2)
34.50.0345
P1 cortexAATATGGATG (4)
CAAAGGCTTT (2)
GAAAATGAGA
13.50.0135
HypothalamusAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAGGAGACAG (2)
GAAAATGAGA
23.50.0235
E12.5 retinaAAGTCAACGT
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAAAATGAGA
GAGGAATGTG (3)
31.90.0319
E14.5 retinaAAGTCAACGT
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
GAAAATGAGA
TAGTCAGCAC (2)
705.10.7051
E16.5 retinaAAAGCCCTGC (2)
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
GAAAATGAGA
GAGGAATGTG (3)
GAGGGAATCC
GCTGCTCTTG (3)
GGTCCCAAAA (2)
TAGTCAGCAC (2)
68.80.0688
E18.5 retinaACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAAAATGAGA
GCTTCAAAAA
25.40.0254
P0.5 retinaACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
GAAAATGAGA
GGGCCCAAGC (3)
23.70.0237
P2.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAGGAGACCG
GAAAATGAGA
GAGGAATGTG (3)
TAGTCAGCAC (2)
10.80.0108
P4.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAAAATGAGA
GGGGCGCACA
GGTCCCAAAA (2)
21.80.0218
P6.5 retinaAAGTCAACGT
AATATGGATG (4)
GAAAATGAGA
150.015
P10.5 crx- retinaAAAGCCCTGC (2)
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAAAATGAGA
GAGGAATGTG (3)
GAGGGAATCC
31.60.0316
P10.5 crx+ retinaAAGTCAACGT
AATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
GAAAATGAGA
TAGTCAGCAC (2)
TATTCAGCAC (2)
19.10.0191
Adult retinalAATATGGATG (4)
ACCTCCAGGA (3)
CAGGAGACCG
GAAAATGAGA
GGGGCGCACA
390.039
ONLAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAAAATGAGA
GAGGAATGTG (3)
GCTGCTCTTG (3)
GGGGCGCACA
99.50.0995