Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.308500 Pcdha2protocadherin alpha 2 18    353234 
 Mm.308500 Pcdha8protocadherin alpha 8 18    353235 
 Mm.308500 Pcdhac1protocadherin alpha subfamily C, 1 18    353236 
 Mm.308500 C130024J02RikRIKEN cDNA C130024J02 gene 18    320573 
 Mm.308500 Pcdha4protocadherin alpha 4 18    12936 
 Mm.308500 Pcdha6protocadherin alpha 6 18    12937 
 Mm.308500 Pcdha7protocadherin alpha 7 18    12939 
 Mm.308500 Pcdha5protocadherin alpha 5 18    12941 
 Mm.308500 Pcdha11protocadherin alpha 11 18    12942 
 Mm.308500 Pcdha10protocadherin alpha 10 18    12943 
 Gene Ontology calcium ion binding
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 45 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTAACTGACCT
TGGATTCATT (10)
4.90.0049
Cb medulloblastomaCACAGCTCTG (20)
TGGATTCATT (10)
13.90.0139
P8 GC+1d cultureCAATCCTGCA (10)
CATACAGTGA (10)
TAACTGACCT
TGGATTCATT (10)
9.10.0091
P8 GC+SHH+1d cultureCATACAGTGA (10)
TAACTGACCT
TGGATTCATT (10)
7.10.0071
3T3 fibroblastsCACATAAACA
3.50.0035
P1 cortexCAATCCTGCA (10)
CACAGCTCTG (20)
CATACAGTGA (10)
TGGATTCATT (10)
49.90.0499
HypothalamusCATACAGTGA (10)
GCCTTCAGTC
TGGATTCATT (10)
90.009
E14.5 retinaCACATACACA (4)
TAACTGACCT
5.40.0054
E16.5 retinaGCCTTCAGTC
TAACTGACCT
5.40.0054
E18.5 retinaCACATACACA (4)
TGGATTCATT (10)
5.40.0054
P0.5 retinaCATACAGTGA (10)
TAACTGACCT
TGGATTCATT (10)
7.90.0079
P2.5 retinaTGGATTCATT (10)
3.50.0035
P4.5 retinaTAACTGACCT
TGGATTCATT (10)
11.90.0119
P6.5 retinaTGGATTCATT (10)
1.70.0017
P10.5 crx- retinaCAATCCTGCA (10)
CACATACACA (4)
CATACAGTGA (10)
5.70.0057
P10.5 crx+ retinaCATACAGTGA (10)
GCCTTCAGTC
TAACTGACCT
TGGATTCATT (10)
11.50.0115
Adult retinalCACAGCTCTG (20)
CATACAGTGA (10)
TGGATTCATT (10)
9.40.0094
ONLCACATAAACA
CACATACACA (4)
TGGATTCATT (10)
5.70.0057