Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.329243	1500001E21Rik	RIKEN cDNA 1500001E21 gene	17		75700
Mm.329243	Calm2	calmodulin 2	17		12314
Gene Ontology	calcium ion binding | cell cycle | cytoplasm | G-protein coupled receptor protein signaling pathway | plasma membrane | protein binding
Human Homolog	CALM2[calmodulin 2 (phosphorylase kinase, delta)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 319 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAATGAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CAGGCCGCAC (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) CTGCAAGGGC GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACAACTTT (2) GCACGACTTG (2) GCGCAACTTG (2) GTACAACTTG GTATCTGCCT (2) TGATGACAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTGTTGTTGG (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTCTTCCC (3) TTTTCTTCCT (2) 368.4 0.3684 Cb medulloblastoma AAAAATGAAA (2) AGCAGGTTTT (2) ATCAATGAAC (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACAATTTG (2) GCACGACTTG (2) GCGCAACTTG (2) GTGCCTGTTG GTTGTTTGTT TGATGAAAAA (2) TGATTACAAA (3) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTCTTCCC (3) 702.7 0.7027 P8 GC+1d culture AAAAATGAAA (2) ACAGACAAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) CTGCAAGGGC GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACAACTTT (2) GCACGACTTG (2) GCGCAACTTG (2) GTGCCTGTTG TCCTCTCTCT TGATGACAAA (2) TGATTACAAA (3) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTTATTAATT (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) 341.9 0.3419 P8 GC+SHH+1d culture AAAAATGAAA (2) ACAGACAAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CAGGCCGCAC (2) CCAAGTTGTA (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) CTGCAAGGGC GCACAACTGC (2) GCACAACTTG (2) GCACGACTTG (2) GTGCCTGTGG GTGCCTGTTG TACTGCTTTT TCCTCTCTCT TGATGACAAA (2) TGGCTTACTC (2) TGGTTACTCT (2) TTACTTCATC (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTGTTGTTGG (2) TTTGTTTGTT (2) TTTTCTTCCC (3) TTTTCTTCCT (2) 374.5 0.3745 3T3 fibroblasts ACTCACCTGA (2) CAGGCCGCAC (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTG (2) GTGCCTGTTG GTTGTTTGTT TCCTCTCTCT TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA 119.1 0.1191 E15 cortex AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCTGACCAAC (2) GTGCCTGTGG GTGCCTGTTG TCCTCTCTCT TGGTTACTCT (2) 247.1 0.2471 P1 cortex ACTCACCTGA (2) AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTG (2) GCACAACTTT (2) GTTGTTTGTT TCCTCTCTCT TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) 149.6 0.1496 Hypothalamus AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) CTGCAAGGGC GCACAACTTG (2) GCACAACTTT (2) TGATGACAAA (2) TGATTACAAA (3) TGGCTTACTC (2) TGGTTACTCT (2) TGTTCTTCCC (3) TTACTTCATC (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTGTTGTTGG (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTCTTCCT (2) 351.1 0.3511 E12.5 retina AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) CTGCAAGGGC GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) TAATAGTAAT TGATGACAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGG (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) 163.6 0.1636 E14.5 retina AAAAATGAAA (2) ACAGACAAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTG (2) GTGCCTGTTG TGATGAAAAA (2) TGATGACAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTTATTAATT (2) TTTGTTTGTT (2) 205.7 0.2057 E16.5 retina AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCTGACCAAC (2) GTGCCTGTTG TCCTCTCTCT TGATGACAAA (2) TGGCTTACTC (2) TGGTTACTCT (2) TTACTTCATC (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTCTTCCC (3) TTTTTTCCTT (2) 249.7 0.2497 E18.5 retina AAAAATGAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACAATTTG (2) GCACGACTTG (2) GTGCCTGTTG TACTGCTTTT TGATGACAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTGTTGTTGG (2) TTTATTAATT (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTTTCCTT (2) 345.3 0.3453 P0.5 retina ACTCACCTGA (2) AGCAGGTTTT (2) CAGGCCGCAC (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACAACTTT (2) GCGCAACTTG (2) GTGCCTGTGG GTGCCTGTTG TCCTCTCTCT TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) 271 0.271 P2.5 retina AAAAATGAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CCAAGTTGTA (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTG (2) GCGCAACTTG (2) GCTGACCAAC (2) GTACAACTTG GTGCCTGTGG GTTGTTTGTT TAATAGTAAT TACTGCTTTT TCCTCTCTCT TGATGACAAA (2) TGGCTTACTC (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTGTTGTTGG (2) TTTATTAATT (2) TTTGTTTGTT (2) 269.7 0.2697 P4.5 retina AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACGACTTG (2) GTGCCTGTTG TACTGCTTTT TCCTCTCTCT TGATGACAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTACTTCATC (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTTATTAATT (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTTTCCTT (2) 285.6 0.2856 P6.5 retina AAAAATGAAA (2) ACAGACAAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CCAAGTTGTA (2) CCTGTAATCC (2) CTGACAGTTC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GTGCCTGTTG TCCTCTCTCT TGATGACAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGG (2) TTTATTAATT (2) TTTGTTTGTT (2) 200.3 0.2003 P10.5 crx- retina AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTG (2) GTACAACTTG GTGCCTGTTG GTTGTTTGTT TGATTACAAA (3) TGGCTTACTC (2) TGGTTACTCT (2) TTACTTCATC (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTTGTTGGTG TTTGTTTGTT (2) TTTTTTCCTT (2) 271.6 0.2716 P10.5 crx+ retina AAAAATGAAA (2) AGCAGGTTTT (2) CAGGCCGCAC (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACGACTTG (2) GTACAACTTG GTGCCTGTTG TACTGCTTTT TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTTGTTTGTT (2) 359.3 0.3593 Adult retinal AGCAGGTTTT (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTTC (2) GCACAACTTG (2) GCACAACTTT (2) GCACAATTTG (2) GTGCCTGTTG GTTGTTTGTT TCCTCTCTCT TGATGAAAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTGTTGTTGA (2) TTGTTGTTGG (2) TTTGTTTGTT (2) TTTTCTTCCT (2) 155.9 0.1559 ONL AAAAATGAAA (2) CCTGTAATCC (2) GCACAACTGC (2) GCACAACTTG (2) TACTGCTTTT TCCTCTCTCT TGATGAAAAA (2) TGGTTACTCT (2) TTGATGTTGA TTTATTAATT (2) TTTGTTTGTT (2) 78.3 0.0783