Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.331389 4930599N24RikRIKEN cDNA 4930599N24 gene 3    75383 
 Mm.331389 Ppp3caprotein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isoform 3    19055 
 Gene Ontology calcium ion transport | calmodulin binding | CTD phosphatase activity | dephosphorylation | G1/S transition of mitotic cell cycle | hydrolase activity | manganese ion binding | myosin phosphatase activity | protein binding | protein phosphatase type 1 activity | protein phosphatase type 2A activity | protein phosphatase type 2C activity | protein serine/threonine phosphatase activity | protein serine/threonine phosphatase complex | protein-nucleus import | response to stress
 Human Homolog PPP3CA[protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, alpha isoform (calcineurin A alpha)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 138 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGACTGAT (2)
ATAGTGTAAA (2)
ATCTATACAA (2)
ATGGGATTGC (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
TGCCACAAAA (3)
34.20.0342
Cb medulloblastomaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGACTGAT (2)
AAGGAGGGCA (3)
ATAGTGTAAA (2)
ATGGGATTGC (2)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
CTTTGATCGT (2)
TGCCACAAAA (3)
TGTGACATCC (4)
TTTTTTAAGG (2)
145.50.1455
P8 GC+1d cultureAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
ATAGTGTAAA (2)
ATCTATACAA (2)
CACCTGTACC (2)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTTGATCGT (2)
TGCCACAAAA (3)
TTTTTTAAGG (2)
38.70.0387
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGACTGAT (2)
ATAGTGTAAA (2)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
TGCCACAAAA (3)
TGTGACATCC (4)
TTTTTTAAGG (2)
37.60.0376
E15 cortexAAGGACTGAT (2)
ATGGGATTGC (2)
CCCTGCAGCT (3)
14.70.0147
P1 cortexAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGACTGAT (2)
ATAGTGTAAA (2)
CTTACCTCAG (2)
CTTTGATCGT (2)
45.30.0453
HypothalamusAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
ATCTATACAA (2)
CACCTGTACC (2)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
TGCCACAAAA (3)
TTTTTTAAGG (2)
52.40.0524
E12.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTGAAAA (3)
AATGTAGGCA (2)
CACCTGTACC (2)
CTTACCTCAG (2)
CTTTGATCGT (2)
TAAATGAAGG (2)
TGCCACAAAA (3)
15.20.0152
E14.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AACTTGAAAA (3)
AATGTAGGCA (2)
ATAGTGTAAA (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
CTTTGATCGT (2)
GTAACCGTTA (2)
TTTTTTAAGG (2)
41.70.0417
E16.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
CCCTGCAGCT (3)
CTTTGATCGT (2)
25.40.0254
E18.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AACTTGAAAA (3)
CACCTGTACC (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
GTAACCGTTA (2)
TAAATGAAGG (2)
TGCCACAAAA (3)
TTTTTTAAGG (2)
36.30.0363
P0.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGACTGAT (2)
CCCTCTGACG (2)
CTTTGATCGT (2)
TTTTTTAAGG (2)
13.90.0139
P2.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
CACCTGTACC (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
TGCCACAAAA (3)
TTTTTTAAGG (2)
24.80.0248
P4.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AATGTAGGCA (2)
CCCTGCAGCT (3)
TGTGACATCC (4)
TTTTTTAAGG (2)
29.70.0297
P6.5 retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTTGATCGT (2)
TAAATGAAGG (2)
TGCCACAAAA (3)
TTTTTTAAGG (2)
45.20.0452
P10.5 crx- retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGAGGGCA (3)
AATGTAGGCA (2)
20.50.0205
P10.5 crx+ retinaAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AAGGACTGAT (2)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
230.023
Adult retinalAAAAATAAAA (3)
AACTTAAAAA (3)
AACTTGAAAA (3)
CCCTGCAGCT (3)
9.40.0094
ONLAAGGAGGGCA (3)
CCCTCTGACG (2)
CCCTGCAGCT (3)
CTTACCTCAG (2)
CTTTGATCGT (2)
GTAACCGTTA (2)
210.021