Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.333399 LOC380687similar to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 4    380687 
 Mm.333399 Gapdglyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 6  6 56.0 cM  407972 
 Mm.333399 LOC14433similar to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2    14433 
 Human Homolog GAPD[glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 87 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
97.90.0979
Cb medulloblastomaAGGTCCACCA (3)
GAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
150.10.1501
P8 GC+1d cultureAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
104.90.1049
P8 GC+SHH+1d cultureAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TAGTTGAGGT (4)
151.10.1511
3T3 fibroblastsGCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
GCTCCAAGGA (3)
466.10.4661
E15 cortexGAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
148.30.1483
P1 cortexGCCTCCAAGG (5)
GCTCCAAGGA (3)
127.20.1272
HypothalamusAGGTCCACCA (3)
CCAGTGAGCT (4)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
101.30.1013
E12.5 retinaCCAGTGAGCT (4)
GCCTCCAAGG (5)
TAGTTGAGGT (4)
TTTGTGATGG (4)
253.40.2534
E14.5 retinaAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
TTCCACTATG (3)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
63.70.0637
E16.5 retinaAGGTCCACCA (3)
CCAGTGAGCT (4)
GAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TTTGTGATGG (4)
103.10.1031
E18.5 retinaAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCACTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
1200.12
P0.5 retinaCCAGTGAGCT (4)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
245.30.2453
P2.5 retinaGAGAAGGCCG (3)
GCCTCCAAGG (5)
177.80.1778
P4.5 retinaGCCTCCAAGG (5)
TAGTTGAGGT (4)
TTCCAGTATG (3)
TTTGTGATGG (4)
97.10.0971
P6.5 retinaAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
TAGTTGAGGT (4)
160.10.1601
P10.5 crx- retinaAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TAGTTGAGGT (4)
TTTGTGATGG (4)
364.10.3641
P10.5 crx+ retinaAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
TTCCAGTATG (3)
2710.271
Adult retinalAGGTCCACCA (3)
CCAGTGAGCT (4)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TAGTTGAGGT (4)
TTTGTGATGG (4)
3500.35
ONLAGGTCCACCA (3)
GCCTCCAAGG (5)
GCCTTCCGTG (4)
TTCCACTATG (3)
358.10.3581