Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.334789 1110017C15RikRIKEN cDNA 1110017C15 gene 8    66164 
 Mm.334789 6330509M23RikRIKEN cDNA 6330509M23 gene 8    76155 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 85 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (355)52.20.0522
P8 Cb GCTTGCTGTGTG (5)4.90.0049
P8 Cb GCAGACTGGAAA (7)3.30.0033
P8 Cb GCAGCCTGGAAA (4)3.30.0033
P8 Cb GCATAGCACAGT (3)1.60.0016
P8 Cb GCTTTGAGCAGA (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (355)41.60.0416
Cb medulloblastomaTTGCTGTGTG (5)6.90.0069
Cb medulloblastomaAGACTGGAAA (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaAGCCTGGAAA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaATAGCACAGT (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (355)320.032
P8 GC+1d cultureTTGCTGTGTG (5)6.80.0068
P8 GC+1d cultureATAGCACAGT (3)4.60.0046
P8 GC+1d cultureAGACTGGAAA (7)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGCCACCAAG (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (355)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureTTGCTGTGTG (5)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureAGCCTGGAAA (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureATAGCACAGT (3)2.30.0023
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (355)70.10.0701
3T3 fibroblastsATAGCACAGT (3)3.50.0035
3T3 fibroblastsTTGCTGTGTG (5)3.50.0035
E15 cortexCCTTTAATCC (355)54.40.0544
E15 cortexTTGCTGTGTG (5)4.90.0049
P1 cortexCCTTTAATCC (355)154.50.1545
P1 cortexTTGCTGTGTG (5)4.50.0045
HypothalamusCCTTTAATCC (355)19.90.0199
HypothalamusAGCCTGGAAA (4)3.60.0036
HypothalamusATAGCACAGT (3)1.80.0018
HypothalamusTTGCTGTGTG (5)1.80.0018
E12.5 retinaCCTTTAATCC (355)75.10.0751
E12.5 retinaATAGCACAGT (3)150.015
E12.5 retinaTATGTATGTG (12)3.80.0038
E12.5 retinaTTGCTGTGTG (5)3.80.0038
E14.5 retinaCCTTTAATCC (355)120.30.1203
E14.5 retinaTTGCTGTGTG (5)7.30.0073
E14.5 retinaATAGCACAGT (3)5.50.0055
E14.5 retinaAGCCTGGAAA (4)3.60.0036
E14.5 retinaTATGTATGTG (12)1.80.0018
E16.5 retinaCCTTTAATCC (355)68.80.0688
E16.5 retinaTTGCTGTGTG (5)10.90.0109
E16.5 retinaAGACTGGAAA (7)3.60.0036
E16.5 retinaAGCCTGGAAA (4)1.80.0018
E16.5 retinaTATGTATGTG (12)1.80.0018
E18.5 retinaCCTTTAATCC (355)23.60.0236
E18.5 retinaAGACTGGAAA (7)3.60.0036
E18.5 retinaTTGCTGTGTG (5)3.60.0036
E18.5 retinaATAGCACAGT (3)1.80.0018
P0.5 retinaCCTTTAATCC (355)72.60.0726
P0.5 retinaAGACTGGAAA (7)20.002
P0.5 retinaATAGCACAGT (3)20.002
P0.5 retinaTATGTATGTG (12)20.002
P0.5 retinaTGCCACCAAG (4)20.002
P0.5 retinaTTGCTGTGTG (5)20.002
P2.5 retinaCCTTTAATCC (355)70.40.0704
P2.5 retinaTTGCTGTGTG (5)8.80.0088
P2.5 retinaATAGCACAGT (3)3.50.0035
P2.5 retinaAGACTGGAAA (7)1.80.0018
P2.5 retinaTGCCACCAAG (4)1.80.0018
P4.5 retinaCCTTTAATCC (355)43.60.0436
P4.5 retinaTTGCTGTGTG (5)11.90.0119
P4.5 retinaAGCCTGGAAA (4)20.002
P4.5 retinaATAGCACAGT (3)20.002
P6.5 retinaCCTTTAATCC (355)700.07
P6.5 retinaTTGCTGTGTG (5)26.70.0267
P6.5 retinaAGCCTGGAAA (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (355)63.20.0632
P10.5 crx- retinaTTGCTGTGTG (5)18.60.0186
P10.5 crx- retinaAGCCTGGAAA (4)5.60.0056
P10.5 crx- retinaATAGCACAGT (3)5.60.0056
P10.5 crx- retinaTATGTATGTG (12)3.70.0037
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (355)38.40.0384
P10.5 crx+ retinaTTGCTGTGTG (5)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaATAGCACAGT (3)1.90.0019
Adult retinalCCTTTAATCC (355)129.60.1296
Adult retinalTTGCTGTGTG (5)18.50.0185
Adult retinalAGCCTGGAAA (4)5.60.0056
Adult retinalATAGCACAGT (3)5.60.0056
Adult retinalTATGTATGTG (12)1.90.0019
Adult retinalTGCCACCAAG (4)1.90.0019
ONLCCTTTAATCC (355)84.30.0843
ONLAGCCTGGAAA (4)3.80.0038
ONLTTGCTGTGTG (5)3.80.0038
ONLTTTGAGCAGA (3)1.90.0019