Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.334789	1110017C15Rik	RIKEN cDNA 1110017C15 gene	8		66164
Mm.334789	6330509M23Rik	RIKEN cDNA 6330509M23 gene	8		76155
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 85 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGACTGGAAA AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) TTTGAGCAGA (2) 66.9 0.0669 Cb medulloblastoma AGACTGGAAA AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 55.4 0.0554 P8 GC+1d culture AGACTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TGCCACCAAG (3) TTGCTGTGTG (2) 46.8 0.0468 P8 GC+SHH+1d culture AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 40.9 0.0409 3T3 fibroblasts ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 77.1 0.0771 E15 cortex CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 59.3 0.0593 P1 cortex CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 159 0.159 Hypothalamus AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 27.1 0.0271 E12.5 retina ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TATGTATGTG (2) TTGCTGTGTG (2) 97.7 0.0977 E14.5 retina AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TATGTATGTG (2) TTGCTGTGTG (2) 138.5 0.1385 E16.5 retina AGACTGGAAA AGCCTGGAAA CCTTTAATCC (3) TATGTATGTG (2) TTGCTGTGTG (2) 86.9 0.0869 E18.5 retina AGACTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 32.6 0.0326 P0.5 retina AGACTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TATGTATGTG (2) TGCCACCAAG (3) TTGCTGTGTG (2) 82.6 0.0826 P2.5 retina AGACTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TGCCACCAAG (3) TTGCTGTGTG (2) 86.3 0.0863 P4.5 retina AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 59.5 0.0595 P6.5 retina AGCCTGGAAA CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 98.4 0.0984 P10.5 crx- retina AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TATGTATGTG (2) TTGCTGTGTG (2) 96.7 0.0967 P10.5 crx+ retina ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) 46.1 0.0461 Adult retinal AGCCTGGAAA ATAGCACAGT (3) CCTTTAATCC (3) TATGTATGTG (2) TGCCACCAAG (3) TTGCTGTGTG (2) 163.1 0.1631 ONL AGCCTGGAAA CCTTTAATCC (3) TTGCTGTGTG (2) TTTGAGCAGA (2) 93.8 0.0938