Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.41702 6230403H02RikRIKEN cDNA 6230403H02 gene 12    67779 
 Mm.41702 1110038H03RikRIKEN cDNA 1110038H03 gene 12    66189 
 Mm.41702 Sox11SRY-box containing gene 11 12  12  20666 
 Gene Ontology DNA binding | nucleus | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription factor activity | transcription factor complex
 Clusters 
   Neighbors    

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 160 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACAATGGCAT (4)
CAAACTCTAT (3)
CAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
CTGATAACTA
GAATAGATAA (3)
GACTCCCCAC (4)
GCACTGTTAA (3)
GGATTCAACA
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGTGTTT (3)
GTGATCGTGT (3)
TAAACACATC (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGGCTTTTAT (6)
117.30.1173
Cb medulloblastomaCAGAGTGTAG (3)
GGATTCAACA
6.90.0069
P8 GC+1d cultureACAATGGCAT (4)
CAAACTCTAT (3)
CAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CCTCACTTAA (5)
CTCTTAGCAG (3)
GAATAGATAA (3)
GCACTGGTAA (2)
GCACTGTTAA (3)
GGATTCAACA
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGGAAGG (4)
GTGAGTGTTT (3)
TAAACACATC (3)
TATAGAAGTA (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGGCTTTTAT (6)
113.80.1138
P8 GC+SHH+1d cultureACAATGGCAT (4)
CAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CCTCACTTAA (5)
CTCTTAGCAG (3)
CTGATAACTA
GAATAGATAA (3)
GCACTGTTAA (3)
GCAGTCTAGC (3)
GGCACATCCA (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGGATGCAGT (3)
TGGCTTTTAT (6)
83.30.0833
E15 cortexCAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GCAGTCTAGC (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGGAAGG (4)
GTGAGTGTTT (3)
GTGATCGTGT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
395.40.3954
P1 cortexCAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GTGAGTGTTT (3)
GTGATCGTGT (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
63.40.0634
HypothalamusCCTCACTTAA (5)
CTGATAACTA
TATTTGCAAA (4)
5.40.0054
E12.5 retinaCAAACTCTAT (3)
CAAATATGTT (6)
CCTCACTTAA (5)
CTGATAACTA
GAATAGATAA (3)
GACTCCCCAC (4)
GCACTGTTAA (3)
GGATTCAACA
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGGATGCAGT (3)
960.096
E14.5 retinaCAGAGTGTAG (3)
CCTCACTTAA (5)
GCACTGTTAA (3)
GGCACATCCA (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGGATGCAGT (3)
TGTTTTGAAG
38.10.0381
E16.5 retinaCAAATATGTT (6)
CCTCACTTAA (5)
CTGATAACTA
GCACTGTTAA (3)
GGCACATCCA (3)
GTGAGTGTTT (3)
TGGAGGCTCC (4)
34.30.0343
E18.5 retinaCAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CCTCACTTAA (5)
GCACTGTTAA (3)
GGATTCAACA
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGGCTTTTAT (6)
47.30.0473
P0.5 retinaACAATGGCAT (4)
CCTCACTTAA (5)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GTGAGGAAGG (4)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGTTTTGAAG
27.80.0278
P2.5 retinaACAATGGCAT (4)
CAAACTCTAT (3)
CAGAGTGTAG (3)
CCTCACTTAA (5)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
TATAGAAGTA (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
28.40.0284
P4.5 retinaCCTCACTTAA (5)
CTGATAACTA
GCACTGGTAA (2)
GCACTGTTAA (3)
GGATTCAACA
GTGAGTGTTT (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGTTTTGAAG
41.70.0417
P6.5 retinaCCTCACTTAA (5)
GACTCCCCAC (4)
GGATTCAACA
TGTTTTGAAG
200.02
P10.5 crx- retinaCAAATATGTT (6)
CCTCACTTAA (5)
GCACTGGTAA (2)
GGATTCAACA
TGGAGGCTCC (4)
TGTTTTGAAG
11.40.0114
P10.5 crx+ retinaCCTCACTTAA (5)
GGATTCAACA
7.60.0076
Adult retinalCCTCACTTAA (5)
CTGATAACTA
GGATTCAACA
TATAGAAGTA (3)
TGGATGCAGT (3)
11.30.0113
ONLCCTCACTTAA (5)
TGGATGCAGT (3)
9.60.0096