Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4269 5730422P05RikRIKEN cDNA 5730422P05 gene 18    67762 
 Mm.4269 Tcf4transcription factor 4 18    21413 
 Mm.4269 4732423E21RikRIKEN cDNA 4732423E21 gene 18    106967 
 Mm.4269 6030446J10RikRIKEN cDNA 6030446J10 gene 18    320848 
 Mm.4269 9630026C02RikRIKEN cDNA 9630026C02 gene 18    320591 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 216 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTTTGTTT (5)
GATATTACAA (5)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TATTCAGAAA (6)
TGAAGCGCTG (2)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTCTCACCAG (5)
TTGTGCTTGT (5)
127.20.1272
Cb medulloblastomaAAAAAATTAA
AAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
GGACTTGAAG (6)
TAAAAATATA (2)
TATTAAGGAA (5)
TGTGTGCGTG (3)
TTATCATAAA (5)
TTCAGAAATG
43.80.0438
P8 GC+1d cultureAAAAAATTAA
AAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
AGAAAATGAA
ATGTGACTTT (7)
CAGCATTGCC (5)
GATATTACAA (5)
GGACAGATGT (5)
GGTTTGTAAA (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TATTAAGGAA (5)
TATTCAGAAA (6)
TCGTTTTCTT (5)
TGAAGCGCTG (2)
TGATTCGCTG (5)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TTATCATAAA (5)
TTCAGAAATG
TTCTCACCAG (5)
TTGTGCTTGT (5)
TTTGTTTGTC (3)
117.20.1172
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAATTAA
AAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTGACTTT (7)
CCTGACCAAT (6)
GGACAGATGT (5)
GGTTTGTAAA (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TATTAAGGAA (5)
TCGTTTTCTT (5)
TGATTCGCTG (5)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTCTCACCAG (5)
TTGTGCTTGT (5)
100.60.1006
3T3 fibroblastsCCAAGATTGT (6)
GGACAGATGT (5)
TATCAGTGCC (5)
TTCAGAAATG
17.50.0175
E15 cortexAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TATCAGTGCC (5)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
88.90.0889
P1 cortexAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
CCAAGATTGT (6)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TATCAGTGCC (5)
TATTAAGGAA (5)
TCGTTTTCTT (5)
TGTGTGCGTG (3)
TTGTGCTTGT (5)
113.40.1134
HypothalamusAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TAAAAATATA (2)
90.009
E12.5 retinaAAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATTCAGAAA (6)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTTCCATT (5)
TTCAGAAATG
TTTGTTTGTC (3)
17.10.0171
E14.5 retinaACCGTTCTGT (5)
AGAAAATGAA
CAGCATTGCC (5)
GAAGAAAAAG (2)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TTCAGAAATG
27.30.0273
E16.5 retinaAAAAAATTAA
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
CCAAGATTGT (6)
GTCAGATTTT (6)
TGAAGCGCTG (2)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TGTTTCCATT (5)
TTCAGAAATG
32.50.0325
E18.5 retinaAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
CAGCATTGCC (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TGAAGCGCTG (2)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTTGTTTGTC (3)
47.20.0472
P0.5 retinaAAAAAATTGA (6)
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
ATGTGACTTT (7)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TTATCATAAA (5)
TTCAGAAATG
33.50.0335
P2.5 retinaAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
AGAAAATGAA
ATGTTTGTTT (5)
CAGCATTGCC (5)
CCAAGATTGT (6)
GGACAGATGT (5)
GGTTTGTAAA (5)
GTCAGATTTT (6)
TAGACTCTTG (7)
TATCAGTGCC (5)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTGTGCTTGT (5)
550.055
P4.5 retinaAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
AGAAAATGAA
ATGTTTGTTT (5)
CAGCATTGCC (5)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TCGTTTTCTT (5)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTGTGCTTGT (5)
41.90.0419
P6.5 retinaAAAAAATTGA (6)
AAATTGCAGC (6)
AACGTTTTTG (5)
ACCGTTCTGT (5)
GAAGAAAAAG (2)
GGACAGATGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TAAAAATATA (2)
TATCAGTGCC (5)
TGTGTGCGTG (3)
TTATCATAAA (5)
TTCAGAAATG
38.60.0386
P10.5 crx- retinaAAAAAATTGA (6)
ACCGTTCTGT (5)
CCTGACCAAT (6)
GAAGAAAAAG (2)
TATTCAGAAA (6)
TGAAGCGCTG (2)
TGTGTGCGTG (3)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTTGTTTGTC (3)
46.60.0466
P10.5 crx+ retinaAAATTGCAGC (6)
ACCGTTCTGT (5)
CCTGACCAAT (6)
GGACAGATGT (5)
GGACTTGAAG (6)
GTCAGATTTT (6)
TATTCAGAAA (6)
TGTTACTGAA (5)
TTCAGAAATG
TTGTGCTTGT (5)
47.90.0479
Adult retinalACCGTTCTGT (5)
CCAAGATTGT (6)
CCTGACCAAT (6)
TATCAGTGCC (5)
TGTGTGCGTG (3)
TTCAGAAATG
TTGTGCTTGT (5)
TTTGTTTGTC (3)
26.30.0263
ONLAAAAAATTAA
ACCGTTCTGT (5)
GTCAGATTTT (6)
TTCAGAAATG
TTCTCACCAG (5)
15.20.0152