Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.45602 Brd8bromodomain containing 8 18    78656 
 Mm.45602 4432404P07RikRIKEN cDNA 4432404P07 gene 18    70787 
 Gene Ontology receptor activity
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 94 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATAACTGAGT (5)
CAGACTGTGG (3)
GAAGATGAAG (4)
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
53.70.0537
Cb medulloblastomaATAACTGAGT (5)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
TATGTGTGCA (3)
34.60.0346
P8 GC+1d cultureATAACTGAGT (5)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
TGGAATTCTT (4)
TGTGCTCCCA (2)
31.90.0319
P8 GC+SHH+1d cultureATAACTGAGT (5)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TGGAATTCTT (4)
31.60.0316
3T3 fibroblastsGCGGCGCAGC
3.50.0035
E15 cortexATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
29.60.0296
P1 cortexATAACTGAGT (5)
GGTTTTGTTA (3)
TATGTGTGCA (3)
18.10.0181
HypothalamusATAACTGAGT (5)
CAGACTGTGG (3)
GGCTCTGTTA (2)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
TGTGCTCCCA (2)
180.018
E12.5 retinaATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
TGTGCTCCCA (2)
35.80.0358
E14.5 retinaATAACTGAGT (5)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
TATGTGTGCA (3)
25.40.0254
E16.5 retinaATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
TATGTGTGCA (3)
TCATTTGGCC (2)
TGTTCTTCCT (2)
32.60.0326
E18.5 retinaATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
14.50.0145
P0.5 retinaATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
TGGAATTCTT (4)
27.50.0275
P2.5 retinaATAACTGAGT (5)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
TGGAATTCTT (4)
38.80.0388
P4.5 retinaATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
TATGTGTGCA (3)
TCATTTGGCC (2)
27.80.0278
P6.5 retinaATAACTGAGT (5)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
23.30.0233
P10.5 crx- retinaATAACTGAGT (5)
CAGACTGTGG (3)
GCGGCGCAGC
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TATGTGTGCA (3)
TGTTCTTCCT (2)
31.70.0317
P10.5 crx+ retinaATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
TATGTGTGCA (3)
TGTGCTCCCA (2)
230.023
Adult retinalATAACTGAGT (5)
TATGTGTGCA (3)
9.30.0093
ONLATAACTGAGT (5)
GGCTCTGTTA (2)
GGTTTTGTTA (3)
TAGGCCAAAC (2)
9.50.0095