Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4908 Csngcasein gamma 5  5 44.93 cM  12993 
 Gene Ontology extracellular | extracellular space | transport | transporter activity
 Human Homolog CSN1S2A[casein alpha s2-like A]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (355)52.20.0522
P8 Cb GCGTTAACTGAA (2)6.50.0065
P8 Cb GCTGTAGTTCCA (2)6.50.0065
P8 Cb GCGGGTTCTTCG (2)3.30.0033
P8 Cb GCGTCACCATCC (5)3.30.0033
P8 Cb GCTCTCCCTTTT (3)1.60.0016
P8 Cb GCTTAATTGAAG (3)1.60.0016
P8 Cb GCTTTTCTGGTT (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (355)41.60.0416
Cb medulloblastomaTGTAGTTCCA (2)4.60.0046
Cb medulloblastomaTTAATTGAAG (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (355)320.032
P8 GC+1d cultureTGTAGTTCCA (2)11.40.0114
P8 GC+1d cultureGTTAACTGAA (2)5.70.0057
P8 GC+1d cultureTCTCCCTTTT (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTTCTTCCAAA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (355)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureTGTAGTTCCA (2)8.20.0082
P8 GC+SHH+1d cultureGTTAACTGAA (2)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureGGGTTCTTCG (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTCACCATCC (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTAATTGAAG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTTCTGGTT (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (355)70.10.0701
3T3 fibroblastsGTTAACTGAA (2)70.007
3T3 fibroblastsTTCTTCCAAA (3)3.50.0035
E15 cortexCCTTTAATCC (355)54.40.0544
E15 cortexTGTAGTTCCA (2)9.90.0099
E15 cortexGTTAACTGAA (2)4.90.0049
P1 cortexCCTTTAATCC (355)154.50.1545
P1 cortexGTTAACTGAA (2)13.60.0136
P1 cortexGTTTAATGAA (5)4.50.0045
P1 cortexTGTAGTTCCA (2)4.50.0045
HypothalamusCCTTTAATCC (355)19.90.0199
HypothalamusTGTAGTTCCA (2)9.10.0091
HypothalamusTTTTCTGGTT (4)3.60.0036
HypothalamusGGGTTCTTCG (2)1.80.0018
HypothalamusGTGGTGAGGA (2)1.80.0018
HypothalamusTCTCCCTTTT (3)1.80.0018
HypothalamusTTAATTGAAG (3)1.80.0018
E12.5 retinaCCTTTAATCC (355)75.10.0751
E12.5 retinaTGTAGTTCCA (2)13.10.0131
E12.5 retinaGTTTAATGAA (5)5.60.0056
E12.5 retinaGTTAACTGAA (2)1.90.0019
E12.5 retinaTTAATTGAAG (3)1.90.0019
E14.5 retinaCCTTTAATCC (355)120.30.1203
E14.5 retinaGTTTAATGAA (5)10.90.0109
E14.5 retinaTTAATTGAAG (3)9.10.0091
E14.5 retinaTGTAGTTCCA (2)5.50.0055
E14.5 retinaGTTAACTGAA (2)3.60.0036
E14.5 retinaTGGCCCCAGC (4)3.60.0036
E14.5 retinaGGGTTCTTCG (2)1.80.0018
E14.5 retinaTTCTTCCAAA (3)1.80.0018
E14.5 retinaTTTTCTGGTT (4)1.80.0018
E16.5 retinaCCTTTAATCC (355)68.80.0688
E16.5 retinaTGTAGTTCCA (2)9.10.0091
E16.5 retinaTTAATTGAAG (3)7.20.0072
E16.5 retinaGTTTAATGAA (5)5.40.0054
E16.5 retinaGTTAACTGAA (2)3.60.0036
E16.5 retinaTTTTCTGGTT (4)3.60.0036
E18.5 retinaCCTTTAATCC (355)23.60.0236
E18.5 retinaTGTAGTTCCA (2)9.10.0091
E18.5 retinaGTTTAATGAA (5)3.60.0036
E18.5 retinaGGGTTCTTCG (2)1.80.0018
E18.5 retinaGTTAACTGAA (2)1.80.0018
E18.5 retinaTACACCCCCA (3)1.80.0018
P0.5 retinaCCTTTAATCC (355)72.60.0726
P0.5 retinaTGTAGTTCCA (2)11.80.0118
P0.5 retinaGTTAACTGAA (2)7.90.0079
P0.5 retinaGTTTAATGAA (5)3.90.0039
P0.5 retinaTTAATTGAAG (3)3.90.0039
P0.5 retinaCTCTAAGCCA (2)20.002
P0.5 retinaGTCACCATCC (5)20.002
P2.5 retinaCCTTTAATCC (355)70.40.0704
P2.5 retinaGTTTAATGAA (5)5.30.0053
P2.5 retinaTGTAGTTCCA (2)5.30.0053
P2.5 retinaGTCACCATCC (5)1.80.0018
P2.5 retinaTACACCCCCA (3)1.80.0018
P2.5 retinaTTAATTGAAG (3)1.80.0018
P4.5 retinaCCTTTAATCC (355)43.60.0436
P4.5 retinaTGTAGTTCCA (2)11.90.0119
P4.5 retinaGTTTAATGAA (5)9.90.0099
P4.5 retinaGTCACCATCC (5)40.004
P4.5 retinaGTTAACTGAA (2)40.004
P6.5 retinaCCTTTAATCC (355)700.07
P6.5 retinaTGTAGTTCCA (2)6.70.0067
P6.5 retinaGTTAACTGAA (2)3.30.0033
P6.5 retinaTTTTCTGGTT (4)3.30.0033
P6.5 retinaGTTTAATGAA (5)1.70.0017
P6.5 retinaTTAATTGAAG (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (355)63.20.0632
P10.5 crx- retinaTACACCCCCA (3)14.90.0149
P10.5 crx- retinaGTTAACTGAA (2)5.60.0056
P10.5 crx- retinaCTCTAAGCCA (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGGGTTCTTCG (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTGTAGTTCCA (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTGGCCCCAGC (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTTAATTGAAG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (355)38.40.0384
P10.5 crx+ retinaTGTAGTTCCA (2)13.50.0135
P10.5 crx+ retinaGTTTAATGAA (5)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaGGGTTCTTCG (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTCACCATCC (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTGGTGAGGA (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTCTTCCAAA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTTTCTGGTT (4)1.90.0019
Adult retinalCCTTTAATCC (355)129.60.1296
Adult retinalGTCACCATCC (5)1.90.0019
Adult retinalGTTTAATGAA (5)1.90.0019
Adult retinalTGTAGTTCCA (2)1.90.0019
ONLCCTTTAATCC (355)84.30.0843
ONLGTTTAATGAA (5)7.70.0077
ONLTGTAGTTCCA (2)5.70.0057
ONLGTCACCATCC (5)1.90.0019
ONLGTTAACTGAA (2)1.90.0019
ONLTTAATTGAAG (3)1.90.0019