Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.4908	Csng	casein gamma	5	5 44.93 cM	12993
Gene Ontology	extracellular | extracellular space | transport | transporter activity
Human Homolog	CSN1S2A[casein alpha s2-like A]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATCC (3) GGGTTCTTCG GTCACCATCC GTTAACTGAA TCTCCCTTTT TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) TTTTCTGGTT (3) 76.6 0.0766 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (3) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) 48.5 0.0485 P8 GC+1d culture CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA TCTCCCTTTT TGTAGTTCCA TTCTTCCAAA (2) 52.5 0.0525 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATCC (3) GGGTTCTTCG GTCACCATCC GTTAACTGAA TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) TTTTCTGGTT (3) 44.7 0.0447 3T3 fibroblasts CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA TTCTTCCAAA (2) 80.6 0.0806 E15 cortex CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA TGTAGTTCCA 69.2 0.0692 P1 cortex CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA 177.1 0.1771 Hypothalamus CCTTTAATCC (3) GGGTTCTTCG GTGGTGAGGA TCTCCCTTTT TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) TTTTCTGGTT (3) 39.8 0.0398 E12.5 retina CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) 97.6 0.0976 E14.5 retina CCTTTAATCC (3) GGGTTCTTCG GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGGCCCCAGC (3) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) TTCTTCCAAA (2) TTTTCTGGTT (3) 158.4 0.1584 E16.5 retina CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) TTTTCTGGTT (3) 97.7 0.0977 E18.5 retina CCTTTAATCC (3) GGGTTCTTCG GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TACACCCCCA (2) TGTAGTTCCA 41.7 0.0417 P0.5 retina CCTTTAATCC (3) CTCTAAGCCA GTCACCATCC GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) 104.1 0.1041 P2.5 retina CCTTTAATCC (3) GTCACCATCC GTTTAATGAA (5) TACACCCCCA (2) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) 86.4 0.0864 P4.5 retina CCTTTAATCC (3) GTCACCATCC GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA 73.4 0.0734 P6.5 retina CCTTTAATCC (3) GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) TTTTCTGGTT (3) 86.7 0.0867 P10.5 crx- retina CCTTTAATCC (3) CTCTAAGCCA GGGTTCTTCG GTTAACTGAA TACACCCCCA (2) TGGCCCCAGC (3) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) 98.6 0.0986 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (3) GGGTTCTTCG GTCACCATCC GTGGTGAGGA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA TTCTTCCAAA (2) TTTTCTGGTT (3) 67.2 0.0672 Adult retinal CCTTTAATCC (3) GTCACCATCC GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA 135.3 0.1353 ONL CCTTTAATCC (3) GTCACCATCC GTTAACTGAA GTTTAATGAA (5) TGTAGTTCCA TTAATTGAAG (2) 103.4 0.1034