Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.5305	D4Mgi39	DNA Segment, Chr 4, Mouse Genome Informatics 39	4		100258
Mm.5305	Gnb2-rs1	guanine nucleotide binding protein, beta 2, related sequence 1	11	7 31.2 cM	14694
Gene Ontology	GTPase activity | heterotrimeric G-protein complex | intracellular signaling cascade | kinase activity | protein kinase C activation | protein kinase C binding | protein localization | receptor activity | signal transduction
Human Homolog	GNB2L1[guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 314 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCAAAGAGGT (2) CCCTGTGCTT CTGCTGGTGG (2) GCTGCAGTTG GGCCTTGCTG (2) GGGGCCCCCT (2) GGTCCTGCTG GTCTGCCGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGAAGCTG (2) GTGGCGCACG GTTTTGTTTT (2) GTTTTTTTTT (2) TCCATATTTA (3) TCTGCTGTGG TGATGTTGTT TGGAAACTGA (3) TGGAACCTGA TGGAAGCTGA (3) TTATGCTGAT (3) TTCTGTTGAT TTGAAGCTGA 180.8 0.1808 Cb medulloblastoma ACAAGTACAG CTGCTGGTGG (2) GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TCTGCTGTGG TGTTCTGCTG (4) 78.5 0.0785 P8 GC+1d culture CAGAGCCACC (3) CCAAAGAGGT (2) CCTGCTGCTC (4) CTGCTGGTGG (2) GAGGCCAGCA GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GGTCACACTG GGTCCTGCTG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TCCATATTTA (3) TGATGTTGTT TGGAACCTGA TGGAAGCTGA (3) TTCTGTTGAT 167.6 0.1676 P8 GC+SHH+1d culture ATCCTGTCTG (4) CAGAGCCACC (3) CCAAAGAGGT (2) CCAAAGATGT (3) CCTGCTGCTC (4) CTGCTGGTGG (2) GCCACCCAGT (2) GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GGTCCTGCTG GTCTGCCGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTGTTTT (2) GTTTTTTTTT (2) TCCATATTTA (3) TCTGCTGTGG TGATGTTGTT TGGAACCTGA TGGAAGCTGA (3) TGGAAGCTGG TTGAAGCTGA 172 0.172 3T3 fibroblasts CCAAAGAGGT (2) CTGCTGGTGG (2) GCTGCAGTTG GGGGGGGGGG GGTCACACTG GTCCGCTGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG TGGAACCTGA TGGAAGCTGA (3) 343.5 0.3435 E15 cortex AGCAGTCCTC CTGCTGGTGG (2) GAAGGGCAAG GCTGCAGTTG GGGGGGGGGG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG TCTGCTGTGG TGGAAGCTGA (3) TGGAAGCTGG TGTTCTGCTG (4) 281.7 0.2817 P1 cortex AGCAGTCCTC CAGAGCCACC (3) CTGCTGGTGG (2) GCTGCAGTTG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG TCTGCTGATG (6) TGGAACCTGA TTGAAGCTGA 67.9 0.0679 Hypothalamus AACACTTCAA (2) CCCTGTGCTT CGGACTGTGC CTGCTGGTGG (2) GCTGCAGTTG GGCTGCTGAT (2) GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GGTCACACTG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG TGATGTTGTT TGGAAGCTGG TTGAAGCTGA 65 0.065 E12.5 retina ATCCTGTCTG (4) CCAAAGAGGT (2) CCTGCTGCTC (4) GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GTCCGCTGAT (2) GTCTGATGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGAAGCTG (2) GTGGCGCACG GTTTTGTTTT (2) TCTGCTGATG (6) TCTGCTGTGG TGATGTTGTT TGGAACCTGA TTATGCTGAT (3) 276.2 0.2762 E14.5 retina CCAAAGAGGT (2) CGGACTGTGC CTGCTGGTGG (2) GCAGGGGGGG GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TGGAACCTGA TGGAAGCTGA (3) TGGAAGCTGG TTCTGTTGAT TTGAAGCTGA TTTTGCTTAT (2) 180.2 0.1802 E16.5 retina AACACTTCAA (2) CCAAAGAGGT (2) CCTGCTGCTC (4) GCCACCCAGT (2) GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GGCTGCTGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGAAGCTG (2) GTGGCGCACG TGGAAGCTGA (3) TGGAAGCTGG TTCTGTTGAT TTGAAGCTGA 233.5 0.2335 E18.5 retina CCAAAGAGGT (2) CCAAAGATGT (3) CCTGCTGCTC (4) CTGCTGGTGG (2) GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TGATGTTGTT TTCTGTTGAT 143.5 0.1435 P0.5 retina AGCAGTCCTC CCAAAGAGGT (2) CCCTGTGCTT CGGATCTTGG (2) CTGCTGGTGG (2) GAAGGGCAAG GCTGCAGTTG GGGGCCCCCT (2) GGTCACACTG GTCCGCTGAT (2) GTCTGATGAT (2) GTCTGCCGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TGATGTTGTT TGGAACCTGA TGGAAGCTGA (3) TGGAAGCTGG TTGAAGCTGA 216.4 0.2164 P2.5 retina AACACTTCAA (2) CCAAAGAGGT (2) CCCTGTGCTT CTGCTGGTGG (2) GCAGGGGGGG GCTGCAGTTG GCTGGTGGTT GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GTCTGCTGAT (2) GTGGAAGCTG (2) GTGGCGCACG TCTGCTGTGG TGATGTTGTT TGGAACCTGA TTGAAGCTGA 160.2 0.1602 P4.5 retina AACACTTCAA (2) CAGAGCCACC (3) CCAAAGAGGT (2) CCTGCTGCTC (4) CTGCTGGTGG (2) GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GCTGGTGGTT GGGGGGGGGG GGTCACACTG GTCTGATGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TCTGCTGATG (6) TCTGCTGTGG TGATGTTGTT TGGAAGCTGG TTCTGTTGAT 119.1 0.1191 P6.5 retina AACACTTCAA (2) CCTGCTGCTC (4) CGGACTGTGC CTGCTGGTGG (2) GAGGCCAGCA GCCACCCAGT (2) GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GGCCTTGCTG (2) GGGGGGGGGG GGTCACACTG GTCTGCTGAT (2) GTGGAAGCTG (2) GTGGCGCACG GTTTTGTTTT (2) TCTGCTGTGG TGGAAGCTGG TTATGCTGAT (3) TTCTGTTGAT TTTTGCTTAT (2) 173.6 0.1736 P10.5 crx- retina AACACTTCAA (2) ACAAGTACAG ATCCTGTCTG (4) CCAAAGAGGT (2) CCTGCTGCTC (4) CGGATCTTGG (2) CTGCTGGTGG (2) GGGGCCCCCT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGAAGCTG (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TGATGTTGTT TGGAAGCTGA (3) TGGAAGCTGG TTCTGTTGAT TTGAAGCTGA 173 0.173 P10.5 crx+ retina AGCAGTCCTC ATCCTGTCTG (4) CAGAGCCACC (3) CCTGCTGCTC (4) CTGCTGGTGG (2) GAGGCCAGCA GCTGCAGTTG GCTGGTGGTT GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GGTCCTGCTG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTTTTTT (2) TCTGCTGTGG TGGAACCTGA TGGAAGCTGG TTATGCTGAT (3) TTTTGCTTAT (2) 186 0.186 Adult retinal AGCAGTCCTC CCTGCTGCTC (4) CGGATCTTGG (2) CTGCTGGTGG (2) GAAGGGCAAG GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GCTGGTGGTT GGCCTTGCTG (2) GGCTGCTGAT (2) GGGGCCCCCT (2) GGGGGGGGGG GTCTGATGAT (2) GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTGTTTT (2) TGTTCTGCTG (4) TTCTGTTGAT 122.7 0.1227 ONL CTGCTGGTGG (2) GCCATCTGAG (4) GCTGCAGTTG GGGGGGGGGG GTCTGCTGAT (2) GTGGCGCACG GTTTTGTTTT (2) TGGAAACTGA (3) TGGAACCTGA TTCTGTTGAT 68.8 0.0688