| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AGCTCTAAAA CCACACCTTG GCAGGTCCAC
| 4.8 | 0.0048 |
| Cb medulloblastoma | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG CCACACCTTG GCAGGTCCAC TTCCGCGCTT
| 25.3 | 0.0253 |
| P8 GC+1d culture | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG CCCCACCTTG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 36.4 | 0.0364 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 24.6 | 0.0246 |
| 3T3 fibroblasts | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG GCAGGTCCAC
| 17.5 | 0.0175 |
| E15 cortex | AGCTCTATAG
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | AGCTCTATAG GCAGGTCCAC
| 9 | 0.009 |
| Hypothalamus | AGCTCTAAAA CCACACCTTG GCAGGTCCAC TTCCGCGCTT TTCCTGCTAC (3)
| 34.3 | 0.0343 |
| E12.5 retina | AGCTCTAAAA GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 9.4 | 0.0094 |
| E14.5 retina | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 23.7 | 0.0237 |
| E16.5 retina | AGCTCTAAAA CCCCACCTTG GCAGGTCCAC TTCCGCGCTT TTCCTGCTAC (3)
| 23.5 | 0.0235 |
| E18.5 retina | AGCTCTAAAA GCAGGTCCAC
| 16.4 | 0.0164 |
| P0.5 retina | GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 5.9 | 0.0059 |
| P2.5 retina | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 14.1 | 0.0141 |
| P4.5 retina | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 33.7 | 0.0337 |
| P6.5 retina | AGCTCTATAG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 16.6 | 0.0166 |
| P10.5 crx- retina | GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 9.3 | 0.0093 |
| P10.5 crx+ retina | AGCTCTAAAA AGCTCTATAG GCAGGTCCAC TTCCTGCTAC (3)
| 25 | 0.025 |
| Adult retinal | GCAGGTCCAC
| 9.3 | 0.0093 |
| ONL | AGCTCTAAAA CCACACCTTG CCCCACCTTG
| 5.7 | 0.0057 |