Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.6534 Capns1calpain, small subunit 1 7  7 9.5 cM  12336 
 Gene Ontology calcium ion binding | calpain activity
 Human Homolog CAPNS1[calpain, small subunit 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 65 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGCTCTAAAA
CCACACCTTG
GCAGGTCCAC
4.80.0048
Cb medulloblastomaAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
CCACACCTTG
GCAGGTCCAC
TTCCGCGCTT
25.30.0253
P8 GC+1d cultureAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
CCCCACCTTG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
36.40.0364
P8 GC+SHH+1d cultureAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
24.60.0246
3T3 fibroblastsAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
17.50.0175
E15 cortexAGCTCTATAG
4.90.0049
P1 cortexAGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
90.009
HypothalamusAGCTCTAAAA
CCACACCTTG
GCAGGTCCAC
TTCCGCGCTT
TTCCTGCTAC (3)
34.30.0343
E12.5 retinaAGCTCTAAAA
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
9.40.0094
E14.5 retinaAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
23.70.0237
E16.5 retinaAGCTCTAAAA
CCCCACCTTG
GCAGGTCCAC
TTCCGCGCTT
TTCCTGCTAC (3)
23.50.0235
E18.5 retinaAGCTCTAAAA
GCAGGTCCAC
16.40.0164
P0.5 retinaGCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
5.90.0059
P2.5 retinaAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
14.10.0141
P4.5 retinaAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
33.70.0337
P6.5 retinaAGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
16.60.0166
P10.5 crx- retinaGCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
9.30.0093
P10.5 crx+ retinaAGCTCTAAAA
AGCTCTATAG
GCAGGTCCAC
TTCCTGCTAC (3)
250.025
Adult retinalGCAGGTCCAC
9.30.0093
ONLAGCTCTAAAA
CCACACCTTG
CCCCACCTTG
5.70.0057