Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.88216 Snrpbsmall nuclear ribonucleoprotein B 2  2 73.0 cM  20638 
 Mm.88216 D10Mgi26DNA Segment, Chr 10, Mouse Genome Informatics 26 10    103328 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 127 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACAGCAAAA (2)
AACAGTAAAA
AACTTGATCC (2)
CCACGAGGTG
CGAGGTCTGC (2)
GAGTCTCCCT (3)
GGAAAGTCCT (3)
TGGGTTTGGG (2)
34.40.0344
Cb medulloblastomaAACAGCAAAA (2)
AGTCTCCTGG
CCCATTGGAG (4)
CGAGGTCTGC (2)
GAGTCTCCCT (3)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureAAGTCTCCCT (2)
ACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CTACTGCTCT
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
27.30.0273
P8 GC+SHH+1d cultureAACAGCAAAA (2)
AACAGTAAAA
CCACGAGGTG
CCCCCCTCCC (2)
CTACTGCTCT
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
GGGGAGCCGG (2)
41.20.0412
3T3 fibroblastsACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
31.50.0315
E15 cortexAAGTCTCCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
GGAAAGTCCT (3)
GGGGAGCCGG (2)
39.50.0395
P1 cortexGAGTCTCCCT (3)
GGAAAGTCCT (3)
13.60.0136
HypothalamusACGGTGGGGA (2)
AGTCTCCTGG
CCACGAGGTG
CGAGGTCTGC (2)
GAGTCTCCCT (3)
GGGTCCTCTG (3)
10.80.0108
E12.5 retinaAACTGCATAA (2)
ACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
GGAAAGTCCT (3)
63.90.0639
E14.5 retinaAACAGCAAAA (2)
AACTGCATAA (2)
AACTTGATCC (2)
ACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CCCATTGGAG (4)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
72.70.0727
E16.5 retinaAACTGCATAA (2)
AACTTGATCC (2)
ACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CCCCCCTCCC (2)
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
99.50.0995
E18.5 retinaACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CCCCCCTCCC (2)
CGAGGTCTGC (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
TGGGTTTGGG (2)
490.049
P0.5 retinaACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CCCACGAGGT (2)
CGAGGTCTGC (2)
CTACTGCTCT
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
GGGTCCTCTG (3)
TGGGTTTGGG (2)
96.40.0964
P2.5 retinaAACTGCATAA (2)
ACGGTGGGGA (2)
AGTCTCCTGG
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
42.40.0424
P4.5 retinaAGTCTCCTGG
CCACGAGGTG
GAGTCTCCCT (3)
GGGGAGCCGG (2)
GGGTCCTCTG (3)
41.60.0416
P6.5 retinaAACAGTAAAA
ACGGTGGGGA (2)
AGTCTCCTGG
CCACGAGGTG
CCCACGAGGT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
GGGTCCTCTG (3)
36.80.0368
P10.5 crx- retinaCCACGAGGTG
CTACTGCTCT
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
27.90.0279
P10.5 crx+ retinaACGGTGGGGA (2)
CCACGAGGTG
CTACTGCTCT
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
TGGGTTTGGG (2)
17.20.0172
Adult retinalACGGTGGGGA (2)
AGTCTCCTGG
CCACGAGGTG
CCCCCCTCCC (2)
CTACTGCTCT
CTGGGCTCCT (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
GGGTCCTCTG (3)
46.60.0466
ONLAACAGTAAAA
CCCCCCTCCC (2)
GAGTCTCCCT (3)
GAGTCTCCTG (3)
TGGGTTTGGG (2)
28.70.0287