Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.153061 1700023D09RikRIKEN cDNA 1700023D09 gene 19    69445 
 Mm.153061 Stx5asyntaxin 5A 19    56389 
 Mm.153061 B930096F20RikRIKEN cDNA B930096F20 gene 19    319332 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
166.40.1664
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
191.90.1919
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
108.40.1084
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
149.90.1499
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
343.40.3434
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
356.20.3562
P1 cortexCCTTTAATCC (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
254.50.2545
HypothalamusATAGCAGTGT (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
GTGAGGAGAA (3)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
411.10.4111
E12.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
2760.276
E14.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
1071.41.0714
E16.5 retinaATAGCAGTGT (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
GGAAAGATCT (4)
GTGAGGAGAA (3)
TGGTTGCTGG
885.50.8855
E18.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
327.40.3274
P0.5 retinaATAGCAGTGT (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGAGGTGAGG (3)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
290.60.2906
P2.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
283.30.2833
P4.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
229.90.2299
P6.5 retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
GTGAGGAGAA (3)
TGAGGTGAGG (3)
TGGTTGCTGG
268.40.2684
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
GTGAGGAGAA (3)
TGAGGTGAGG (3)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
432.80.4328
P10.5 crx+ retinaATAGCAGTGT (2)
CCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
199.90.1999
Adult retinalCCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
TGGTTGCTGG
TGGTTTCGTT
372.20.3722
ONLACAGTCAGGG (3)
CCTTTAATCC (3)
CTGCAGCCTA (3)
GAGGGCTTGG (4)
GGAAAGATCT (4)
TGGTTGCTGG
511.40.5114