Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.154136 D5Abb2eDNA segment, Chr 5, Abbott 2 expressed 5  5 66.0 cM  27760 
 Mm.154136 2500003M10RikRIKEN cDNA 2500003M10 gene 3    66511 
 Mm.154136 D19Bwg0552eDNA segment, Chr 19, Brigham & Women's Genetics 0552 expressed 19  19 5.0 cM  52861 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGAAGAAATC (4)
AGAATGCCAA (4)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
45.70.0457
Cb medulloblastomaAGAATGCCAA (4)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
39.30.0393
P8 GC+1d cultureAGAAGAAATC (4)
AGACAGAAAG (4)
GAGGAAGAGG (3)
TATGCATCCA (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
55.90.0559
P8 GC+SHH+1d cultureAGACATAAAG (3)
GCAAGACAGA (5)
TATGCATCCA (3)
TGCTGCTCAG
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
48.10.0481
3T3 fibroblastsTATGCATCCA (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
280.028
E15 cortexAGACAGAAAG (4)
GAGGAAGAGG (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
39.50.0395
P1 cortexGAGGAAGAGG (3)
TGCTGCTCGT (4)
13.60.0136
HypothalamusTGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
18.10.0181
E12.5 retinaAGAAGAAATC (4)
AGACATAAAG (3)
GAGGAAGAGG (3)
TATGCATCCA (3)
TGCTGCTCGT (4)
32.10.0321
E14.5 retinaGAGGAAGAGG (3)
TGCTGCTCAG
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
200.02
E16.5 retinaTGCTGCTCAG
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
16.30.0163
E18.5 retinaAGAAGAAATC (4)
AGACATAAAG (3)
AGCCCTTCCC (4)
TATGCATCCA (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
34.40.0344
P0.5 retinaAGAAGAAATC (4)
AGAATGCCAA (4)
AGACAGAAAG (4)
AGACATAAAG (3)
GAGGAAGAGG (3)
TATGCATCCA (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
43.30.0433
P2.5 retinaAGACAGAAAG (4)
AGCCCTTCCC (4)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
66.90.0669
P4.5 retinaAGCCCTTCCC (4)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
39.70.0397
P6.5 retinaAGAAGAAATC (4)
AGACAGAAAG (4)
TATGCATCCA (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
63.40.0634
P10.5 crx- retinaGAGGAAGAGG (3)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
42.80.0428
P10.5 crx+ retinaAGCCCTTCCC (4)
GCAAGACAGA (5)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
55.70.0557
Adult retinalTGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
25.90.0259
ONLAGACAGAAAG (4)
TGCTGCTCGT (4)
TTCGCCCTCC
13.30.0133