Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.196544 Karslysyl-tRNA synthetase 8  8 55.0 cM  85305 
 Gene Ontology ATP binding | intracellular | ligase activity | lysine-tRNA ligase activity | lysyl-tRNA aminoacylation | nucleic acid binding | protein biosynthesis | tRNA aminoacylation for protein translation | tRNA ligase activity
 Human Homolog KARS[lysyl-tRNA synthetase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAAGGGGT
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GCCAACTCCA
11.40.0114
Cb medulloblastomaCAACTATGGT
CTGCCTTAAT
13.80.0138
P8 GC+1d cultureACTTGTAACT
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
9.20.0092
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAAGGGGT
AAGCCAGAGG
ACTTGTAACT
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GGGGGAAAAA (3)
24.60.0246
3T3 fibroblastsCTGCCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
17.50.0175
E15 cortexCCCCACCCCG
CTGCCTTAAT
GGGGGAAAAA (3)
GTCATAGCTG (2)
24.60.0246
P1 cortexCTGCCTTAAT
GGGGGAAAAA (3)
90.009
HypothalamusAAGAAGGAGA
AAGAAGGGGT
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GGGGGAAAAA (3)
14.40.0144
E12.5 retinaCAACTATGGT
CCCCACCCCG
CTGCCTTAAT
45.10.0451
E14.5 retinaAAGAAGGAGA
AAGAAGGGGT
AAGCCAGAGG
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GCCAACTCCA
38.20.0382
E16.5 retinaAAGAAGGGGT
CAACTATGGT
CCCCACCCCG
CTGCCTTAAT
TGCCTTCTAG
16.20.0162
E18.5 retinaAAGAAGGAGA
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GCCAACTCCA
GGGGGAAAAA (3)
29.10.0291
P0.5 retinaCAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
19.60.0196
P2.5 retinaAAGAAGGGGT
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GGGGGAAAAA (3)
GTCATAGCTG (2)
19.50.0195
P4.5 retinaCAACTATGGT
CCCCACCCCG
CTGCCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
TGCCTTCTAG
13.90.0139
P6.5 retinaCAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
18.30.0183
P10.5 crx- retinaAAGAAGGGGT
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
11.20.0112
P10.5 crx+ retinaCAACTATGGT
CTGCCTTAAT
5.70.0057
Adult retinalATGAACACTG (9)
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
20.50.0205
ONLAAGCCAGAGG
ATGAACACTG (9)
CAACTATGGT
CTGCCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
TGCCTTCTAG
34.40.0344