Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.21281 A830049F12RikRIKEN cDNA A830049F12 gene 5    319915 
 Mm.21281 Rnf4ring finger protein 4 5    19822 
 Gene Ontology nucleus | protein ubiquitination | regulation of transcription, DNA-dependent | ubiquitin ligase complex | ubiquitin-protein ligase activity | zinc ion binding
 Human Homolog RNF4[ring finger protein 4]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGCATAGTTT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTATCTGCCT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
TTGGCCAAGT (3)
89.70.0897
Cb medulloblastomaCTTTCCAAAT (3)
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
136.40.1364
P8 GC+1d cultureAGAGATTGAA (2)
AGCATAGTTT (2)
GCCCCGCCCC
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
88.90.0889
P8 GC+SHH+1d cultureAGCATAGTTT (2)
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
114.80.1148
3T3 fibroblastsAGGGCAACAA
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
38.50.0385
E15 cortexGGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
39.50.0395
P1 cortexGCCCCGCCCC
TAAAAAAAAA (3)
54.50.0545
HypothalamusAGAGATTGAA (2)
AGCATAGTTT (2)
AGGCCCCAGA (2)
AGGGCAACAA
CAGCCAGTTC (3)
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTAGAAAACA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TAGAAAAAAA (3)
560.056
E12.5 retinaCTTTCCAAAT (3)
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
52.60.0526
E14.5 retinaAGGGCAACAA
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
TTGGCCAAGT (3)
600.06
E16.5 retinaAGCATAGTTT (2)
CAGCCAGTTC (3)
GCCCCGCCCC
GGTATCAGTC (2)
GTAGAAAACA (2)
TAAAAAAAAA (3)
43.40.0434
E18.5 retinaAGAGATTGAA (2)
AGCATAGTTT (2)
GCCCCGCCCC
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
136.30.1363
P0.5 retinaAGGCCCCAGA (2)
CTTTCCAAAT (3)
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TAGAAAAAAA (3)
66.80.0668
P2.5 retinaAGCATAGTTT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
96.90.0969
P4.5 retinaGCCCCGCCCC
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TTGGCCAAGT (3)
148.60.1486
P6.5 retinaAGCATAGTTT (2)
AGGCCCCAGA (2)
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
90.10.0901
P10.5 crx- retinaCAGCCAGTTC (3)
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTAGAAAACA (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
29.90.0299
P10.5 crx+ retinaAGCATAGTTT (2)
CAGCCAGTTC (3)
GGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
49.90.0499
Adult retinalGCCCCGCCCC
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
31.60.0316
ONLGGCTGAGCCT (2)
GGTATCAGTC (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TACAAAAAAA (2)
TAGAAAAAAA (3)
49.60.0496