Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.251255 Ddx1DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1 12    104721 
 Gene Ontology ATP binding | ATP dependent helicase activity | ATPase activity | cell growth and/or maintenance | helicase activity | hydrolase activity | nucleic acid binding | regulation of translational initiation | ribosome biogenesis | RNA binding | RNA helicase activity | spermatogenesis | spliceosome assembly
 Human Homolog DDX1[DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 173 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
GCTGCAGAAA
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
282.20.2822
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAACA
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CGAGAGTTAG
GAAAAAAAAA (2)
GCTGCAGAAA
TCAGGAAACA (2)
TGGAGTTCTC
TGTATGTCTT (2)
1045.11.0451
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
GCTGCAGAAA
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGGAGTTCTC
TGTATGTCTT (2)
271.40.2714
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAGG (2)
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
395.90.3959
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
TGTATGTCTT (2)
350.035
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TGTATGTCTT (2)
291.80.2918
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
3500.35
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
TCAGGAAACA (2)
TGGAGTTCTC
TGTATGTCTT (2)
237.30.2373
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
AAGGCTTGTG
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGGGAAAATG (2)
TGTATGTCTT (2)
229.20.2292
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
AAGGCTTGTG
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
180.30.1803
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAACA
AAAATAAACT (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
CGAGAGTTAG
GAAAAAAAAA (2)
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
132.10.1321
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAACA
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TATGTAGCAA
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
516.60.5166
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGGGAAAATG (2)
TGTATGTCTT (2)
182.70.1827
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
GCTGCAGAAA
TAGACAGAAG
TATGTAGCAA
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
492.90.4929
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAACA
AAAATAAACT (2)
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
408.20.4082
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAATAAACT (2)
ACAAAAAAAA (2)
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
376.90.3769
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
AACAAAAAAA (2)
AAGGCTTGTG
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
CGAGAGTTAG
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAGG (2)
TATGTAGCAA
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
1450.145
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAACA
AACAAAAAAA (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TAGACAGAGG (2)
TCAGGAAACA (2)
TGTATGTCTT (2)
203.60.2036
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TCAGGAAACA (2)
TGGAGTTCTC
TGTATGTCTT (2)
122.30.1223
ONLAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAACA
AAAATAAACT (2)
ACAAAAAAAA (2)
CAGCTTCCTT
GAAAAAAAAA (2)
TAGACAGAAG
TCAGGAAACA (2)
TGGGAAAATG (2)
TGTATGTCTT (2)
177.90.1779