Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.253264 6030408C04RikRIKEN cDNA 6030408C04 gene 12    217558 
 Gene Ontology ligase activity
 Human Homolog KIAA1333[KIAA1333]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 71 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTTTTATTC
CTCCCACCTT (3)
TATTGTTTAC (2)
11.40.0114
Cb medulloblastomaCTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
TATTGTTTAC (2)
23.10.0231
P8 GC+1d cultureCTCCCACCTT (3)
CTTTTTTTTT (2)
GACACCAGAA
TATTGTTTAC (2)
23.90.0239
P8 GC+SHH+1d cultureCTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
GACACCAGAA
TATTGTTTAC (2)
270.027
3T3 fibroblastsCTCCCACCTT (3)
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
24.50.0245
E15 cortexCTCCCACCTT (3)
CTTTTTTTTT (2)
GAAGAAAACA (2)
GTCATAGCTG (2)
24.60.0246
P1 cortexGAAGAAAACA (2)
TATTGTTTAC (2)
90.009
HypothalamusCTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
TATTGTTTAC (2)
18.10.0181
E12.5 retinaCTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
TATTGTTTAC (2)
33.80.0338
E14.5 retinaCTCCCACCTT (3)
CTTTTTTTTT (2)
GAAGAAAACA (2)
TATTGTTTAC (2)
34.60.0346
E16.5 retinaATTACGCCAA
CTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
TATTGTTTAC (2)
21.80.0218
E18.5 retinaCTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
GACACCAGAA
TATTGTTTAC (2)
27.30.0273
P0.5 retinaATTACGCCAA
CTCCCACCTT (3)
GACACCAGAA
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
25.60.0256
P2.5 retinaCTCCCACCTT (3)
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
28.20.0282
P4.5 retinaATTTTTATTC
CTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
GACACCAGAA
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
65.40.0654
P6.5 retinaCTCCCACCTT (3)
GAAGAAAACA (2)
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
34.90.0349
P10.5 crx- retinaCTCCCACCTT (3)
CTTTTTTTTT (2)
TATTGTTTAC (2)
22.30.0223
P10.5 crx+ retinaCTCCCACCTT (3)
TATTGTTTAC (2)
24.90.0249
Adult retinalATTACGCCAA
CTCCCACCTT (3)
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
46.40.0464
ONLCTCCCACCTT (3)
GTCATAGCTG (2)
TATTGTTTAC (2)
28.70.0287