Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.258204 Nsep1nuclease sensitive element binding protein 1 4  4 D1  22608 
 Mm.258204 1700102N10RikRIKEN cDNA 1700102N10 gene 4    73541 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 124 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGGTTTTTA
GGGTTTTTAT (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
127.30.1273
Cb medulloblastomaGCCCGGGGAT
GGGTTTTTAT (2)
GTGACTGCTG (3)
TAATAAAGAA (2)
TGGTTGCTGG
129.40.1294
P8 GC+1d cultureATCGGGTTTT (2)
CGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GCCCGGGGAT
GGGTTTTTAT (2)
TGGTTGCTGG
100.30.1003
P8 GC+SHH+1d cultureCGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GCCCGGGGAT
GGGTTTTTAT (2)
GTTGCGGTGA (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGTTGCTGG
139.40.1394
3T3 fibroblastsCGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GTCATAGCTG (2)
TGGTTGCTGG
238.30.2383
E15 cortexAGCAGCGAGG (4)
CGGAGACCCT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
GTGACTGCTG (3)
GTTGCGGTGA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
346.10.3461
P1 cortexATCGGGTTTT (2)
GGGGTTTTAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTGACTGCTG (3)
TAATAAAGAA (2)
TGGTTGCTGG
163.50.1635
HypothalamusCGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
373.10.3731
E12.5 retinaATCGGGTTTT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGTTGCTGG
208.50.2085
E14.5 retinaAGCAGCGAGG (4)
CGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGGTTTTTA
GGGTTTTTAT (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
1096.81.0968
E16.5 retinaAGCAGCGAGG (4)
CGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
TGGTTGCTGG
880.10.8801
E18.5 retinaCGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGTTGCTGG
347.40.3474
P0.5 retinaATCGGGTTTT (2)
CGGAGACCCT (2)
GCCCGGGGAT
GGGGTTTTTA
GGGTTTCTAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
TGGTTGCTGG
253.40.2534
P2.5 retinaAGCAGCGAGG (4)
ATCGGGTTTT (2)
CTGCATAGAT (2)
GCCCGGGGAT
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTGCGGTGA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
244.70.2447
P4.5 retinaCGGAGACCCT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGTTGCTGG
2220.222
P6.5 retinaAGCAGCGAGG (4)
ATCGGGTTTT (2)
CTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTGCGGTGA (2)
TGGTTGCTGG
203.40.2034
P10.5 crx- retinaAGCAGCGAGG (4)
CGGAGACCCT (2)
GGGTTTTTAT (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
319.60.3196
P10.5 crx+ retinaCTGCATAGAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
132.60.1326
Adult retinalCGGAGACCCT (2)
GGGGTTTTAT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
229.80.2298
ONLATCGGGTTTT (2)
GGGTTTTTAT (2)
GTCATAGCTG (2)
TAATAAAGAA (2)
TGGGTGCTAG (4)
TGGTTGCTGG
4270.427