Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.262294 AW556556expressed sequence AW556556 17    106817 
 Mm.262294 Dep1diabetic embryopathy 1 17    170624 
 Mm.262294 Qkquaking 17  17 5.9 cM  19317 
 Gene Ontology cytoplasm | locomotory behavior | muscle cell differentiation | nerve ensheathment | nucleic acid binding | nucleus | RNA binding | spermatogenesis | vasculogenesis
 Human Homolog QKI[quaking homolog, KH domain RNA binding (mouse)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 153 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTTTTGGAA (4)
AGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CTGTGTATGT (3)
GCTTTTACAT (3)
GTGACCTCTC (3)
TAAACACTGT
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
48.90.0489
Cb medulloblastomaACTTTTGGAA (4)
AGGCCAAGAA (2)
ATTTTTTTCT
CACACACACA (2)
CTTTTTTTCA
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATTTTGGA (4)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
101.60.1016
P8 GC+1d cultureAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CTTTTTTTCA
GTGACCTCTC (3)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
21.40.0214
P8 GC+SHH+1d cultureAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CTTTTTTTCA
GTGACCTCTC (3)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TAATTTTGGA (4)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
36.40.0364
3T3 fibroblastsAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
GTCATAGCTG (2)
38.50.0385
E15 cortexACTTTTGGAA (4)
CACACACACA (2)
GTCATAGCTG (2)
TAATGAAATT (3)
24.60.0246
P1 cortexAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CTGTGTATGT (3)
TAAACACTGT
TAATGAAATT (3)
68.10.0681
HypothalamusACTTTTGGAA (4)
AGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CCTGCCTGCT (4)
GCTTTTACAT (3)
GTGACCTCTC (3)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
132.10.1321
E12.5 retinaACTTTTGGAA (4)
AGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
GCAGAGGATG (4)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
45.10.0451
E14.5 retinaAGGCCAAGAA (2)
ATTTTTTTCT
CACACACACA (2)
CTTTTTTTCA
GCAGAGGATG (4)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
36.30.0363
E16.5 retinaCACACACACA (2)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
25.30.0253
E18.5 retinaCACACACACA (2)
CCTGCCTGCT (4)
GCTTTTACAT (3)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
23.60.0236
P0.5 retinaAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
GCTTTTACAT (3)
GTCATAGCTG (2)
GTGACCTCTC (3)
TAAACACTGT
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
49.20.0492
P2.5 retinaACTTTTGGAA (4)
AGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CTTTTTTTCA
GCTTTTACAT (3)
GTCATAGCTG (2)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TCAAGTGAGC (3)
TTGTTTGTAA (3)
56.50.0565
P4.5 retinaATTTTTTTCT
CACACACACA (2)
CCTGCCTGCT (4)
GTCATAGCTG (2)
TAAACACTGT
TAAGTCTCGG (2)
TTGTTTGTAA (3)
27.80.0278
P6.5 retinaAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAACACTGT
TAAGATAATG (3)
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
250.025
P10.5 crx- retinaACTTTTGGAA (4)
AGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
CTTTTTTTCA
TAAACACTGT
TAAGTCTCGG (2)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
TAAACACTGT
TAAGTCTCGG (2)
TAATGAAATT (3)
TTGTTTGTAA (3)
230.023
Adult retinalAGGCCAAGAA (2)
CACACACACA (2)
GTCATAGCTG (2)
TAAACACTGT
TAAGTCTCGG (2)
24.30.0243
ONLATTTTTTTCT
CACACACACA (2)
CTGTGTATGT (3)
GTCATAGCTG (2)
TAAACACTGT
34.40.0344