| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AATTTAATTA TGTGTTGTTT (2)
| 13.1 | 0.0131 |
| Cb medulloblastoma | AATCCCCAAT AATTTAATTA GCATCCAAAA GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 13.8 | 0.0138 |
| P8 GC+1d culture | AATTTAATTA ACTCCTTGGA GCATCCAAAA GCATCCAAGG (2) GGCTCCCAGC GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 15.9 | 0.0159 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AATTAATTAA (2) AATTTAATTA GCATCCAAAA GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 17.6 | 0.0176 |
| E15 cortex | TGTGTTGTTT (2)
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | AATTAATTAA (2) TGTGTTGTTT (2)
| 13.6 | 0.0136 |
| Hypothalamus | AATTAATTAA (2) AATTTAATTA GCATCCAAAA GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 16.2 | 0.0162 |
| E12.5 retina | AATCCCCAAT GCATCCAAAA GCATCCAAGG (2) TGTGTTGTTT (2)
| 17 | 0.017 |
| E14.5 retina | AATTAATTAA (2) TGTGTTGTTT (2)
| 5.4 | 0.0054 |
| E16.5 retina | AATTAATTAA (2) GCAATCAAGG GGCTCCCAGC TGTGTTGTTT (2)
| 9 | 0.009 |
| E18.5 retina | GCATCCAAAA TGTGTTGTTT (2)
| 9.1 | 0.0091 |
| P0.5 retina | AATTTAATTA TGTGTTGTTT (2)
| 7.9 | 0.0079 |
| P2.5 retina | AATTAATTAA (2) GCATCCAAAA GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 17.7 | 0.0177 |
| P4.5 retina | GGCTCCCAGC GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 15.9 | 0.0159 |
| P6.5 retina | AATTAATTAA (2) AATTTAATTA GCATCCAAAA TGTGTTGTTT (2)
| 26.7 | 0.0267 |
| P10.5 crx- retina | AATTAATTAA (2) TGTGTTGTTT (2)
| 11.2 | 0.0112 |
| P10.5 crx+ retina | AATTAATTAA (2) AATTTAATTA GCATCCAAAA GGCTGACGGA TGTGTTGTTT (2)
| 15.3 | 0.0153 |
| Adult retinal | AATTAATTAA (2) AATTTAATTA GCAATCAAGG GCATCCAAGG (2)
| 9.4 | 0.0094 |
| ONL | AATTAATTAA (2) AATTTAATTA GCATCCAAGG (2) TGTGTTGTTT (2)
| 13.4 | 0.0134 |