Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.271985 Snapc3small nuclear RNA activating complex, polypeptide 3 4    77634 
 Mm.271985 E030018J20RikRIKEN cDNA E030018J20 gene 4    319879 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 120 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACTTAAAAA (3)
AAGCTTGGCT (3)
GTCAGAGCAG
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
TGGGTTCCTT
TTTGTGTGTG
29.30.0293
Cb medulloblastomaAACTTAAAAA (3)
GTTGGTCTGT (4)
TCGGGTGGGT
TGGGTTCCTT
TTTGTGTGTG
83.20.0832
P8 GC+1d cultureAACTTAAAAA (3)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
TGGGTTCCTT
TTTCTTTTGT (2)
33.10.0331
P8 GC+SHH+1d cultureAACTTAAAAA (3)
ACCAAAGCAA (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
TTGGTACTGG (3)
TTTGTGTGTG
34.10.0341
3T3 fibroblastsGTCAGAGCAG
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
24.50.0245
E15 cortexGTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCGGGTGGGT
TGGGTTCCTT
TTTCTTTTGT (2)
29.50.0295
P1 cortexAACTTAAAAA (3)
GTTGGTCTGT (4)
TGGGTTCCTT
TTTGTGTGTG
40.90.0409
HypothalamusAACTTAAAAA (3)
AAGCTTGGCT (3)
GTTGGTCTGT (4)
18.10.0181
E12.5 retinaATGCTTGTAA
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
TTTGTGTGTG
15.10.0151
E14.5 retinaAACTTAAAAA (3)
ACCAAAGCAA (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
21.70.0217
E16.5 retinaAACTTAAAAA (3)
ATGCTTGTAA
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCACCGTCTG (3)
TCGGGTGGGT
TGGGTTCCTT
34.30.0343
E18.5 retinaAACTTAAAAA (3)
AAGCTTGGCT (3)
GTTGGTCTGT (4)
TACATACATT (2)
TATGGATACC (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
TTTCTTTTGT (2)
27.20.0272
P0.5 retinaAACTTAAAAA (3)
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
35.30.0353
P2.5 retinaAACTTAAAAA (3)
ATGCTTGTAA
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TTTGTGTGTG
14.20.0142
P4.5 retinaAACTTAAAAA (3)
ATGTTATATT (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TTTGTGTGTG
29.70.0297
P6.5 retinaAACTTAAAAA (3)
AAGCTTGGCT (3)
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
26.80.0268
P10.5 crx- retinaAACTTAAAAA (3)
ACCAAAGCAA (2)
ATGTTATATT (2)
GTCAGAGCAG
GTTGGTCTGT (4)
TATGGATACC (4)
TCACAGGTGT (5)
TTTCTTTTGT (2)
35.40.0354
P10.5 crx+ retinaAACTTAAAAA (3)
ACCAAAGCAA (2)
GTTGGTCTGT (4)
TACATACATT (2)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
26.90.0269
Adult retinalAACTTAAAAA (3)
ACCAAAGCAA (2)
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TACATACATT (2)
TCACAGGTGT (5)
TCGGGTGGGT
TTGGTACTGG (3)
TTTGTGTGTG
24.40.0244
ONLACCAAAGCAA (2)
ATGCTTGTAA
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCGGGTGGGT
TGAAATGTAA (2)
TTGGTACTGG (3)
TTTCTTTTGT (2)
TTTGTGTGTG
34.20.0342