Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.33263 5430410E06RikRIKEN cDNA 5430410E06 gene 17    71413 
 Mm.33263 Ssfa1sperm specific antigen 1 15    20826 
 Mm.33263 H2-D1histocompatibility 2, D region locus 1 17  17 19.09 cM  14964 
 Mm.33263 H2-Lhistocompatibility 2, D region 17  17 19.13 cM  14980 
 Mm.33263 H2-Q2histocompatibility 2, Q region locus 2 17  17 19.15 cM  15013 
 Gene Ontology defense response | integral to membrane
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 175 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGAGCTGTGG
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TTAAAGTCAG
109.10.1091
Cb medulloblastomaAAAAGGTTGA
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
175.70.1757
P8 GC+1d cultureAAAAGGTTGA
GACTGCAGTT
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
117.50.1175
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAGGTTGA
CTGCTCCTGC (3)
GACTGCAGTT
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
161.50.1615
3T3 fibroblastsGAGCTTGTAG (2)
GTGGGCTCAC (6)
GTGGTTCACA (2)
TGAGACTGTG (2)
TGGTTGCTGG
255.80.2558
E15 cortexCTGCTCCTGC (3)
GGAGCTGTGG
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
316.50.3165
P1 cortexGTGGCTCCCA
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
1410.141
HypothalamusAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
402.10.4021
E12.5 retinaAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GGAGCTGTGG
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
219.80.2198
E14.5 retinaAAAAGGTTGA
CTGCTCCTGC (3)
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTCCCACC
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
10221.022
E16.5 retinaAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTCCCACC
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
TTAAAGTCAG
856.50.8565
E18.5 retinaAAAAGGTTGA
GATTGAGAAT (7)
GTGGCTCCCA
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
336.50.3365
P0.5 retinaAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTCCCACC
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
2630.263
P2.5 retinaAAAAGGTTGA
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
225.30.2253
P4.5 retinaAAAAGGTTGA
GATTGAGAAT (7)
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
221.90.2219
P6.5 retinaAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GGAGCTGTGG
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
2150.215
P10.5 crx- retinaAAAAGGTTGA
GATTGAGAAT (7)
GGAGCTGTGG
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
341.90.3419
P10.5 crx+ retinaAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGAGCTGTGG
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
172.90.1729
Adult retinalAAAAGGTTGA
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGAGCTGTGG
GGGCTCACAA
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
TGTTGAGAGA
3020.302
ONLAAAAGGTTGA
GACTGCAGTT
GAGCTTGTAG (2)
GATTGAGAAT (7)
GGAGCTGTGG
GTGGCTCCCA
GTGGGCTCAC (6)
GTGGGTCACA (7)
GTGGTTCACA (2)
TGGTTGCTGG
488.30.4883