Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.34701 Pum1pumilio 1 (Drosophila) 4  4 D2.3  80912 
 Mm.34701 2810017D21RikRIKEN cDNA 2810017D21 gene 4    72638 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 10 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 110 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGAGAATACC (2)
CCCACTGGCC
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
TGGACACTTT (2)
TTATGTGTAA (3)
47.20.0472
Cb medulloblastomaCCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
TGGACACTTT (2)
TTATGTGTAA (3)
TTCCTGCTGC (2)
27.60.0276
P8 GC+1d cultureAGAGAATACC (2)
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
TTATGTGTAA (3)
TTCCTGCTGC (2)
27.40.0274
P8 GC+SHH+1d cultureAGAGAATACC (2)
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
GGGGGGGTGG
TGGACACTTT (2)
TTATGTGTAA (3)
TTCCTGCTGC (2)
29.30.0293
3T3 fibroblastsCCCAGGTCTC
GGGCAGCTGG
GGGGGGGTGG
280.028
E15 cortexAGAGAATACC (2)
CCCAGGTCTC
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
TGGACACTTT (2)
44.30.0443
HypothalamusGGGCAGCTGG
TCCTATCATT (3)
3.60.0036
E12.5 retinaCCCACTGGCC
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
GGGGGGGTGG
TGGACACTTT (2)
22.60.0226
E14.5 retinaCCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
TCCTATCATT (3)
TGTTTTGAAG
TTATGTGTAA (3)
34.50.0345
E16.5 retinaCCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
36.20.0362
E18.5 retinaCCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
TGGACACTTT (2)
12.70.0127
P0.5 retinaAGAGAATACC (2)
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
TGTTTTGAAG
TTATGTGTAA (3)
TTCCTGCTGC (2)
41.30.0413
P2.5 retinaAGAGAATACC (2)
CCCACTGGCC
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
TTATGTGTAA (3)
72.20.0722
P4.5 retinaCCCACTGGCC
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
TGTTTTGAAG
73.30.0733
P6.5 retinaAGAGAATACC (2)
CCCACTGGCC
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
TGTTTTGAAG
58.40.0584
P10.5 crx- retinaAGAGAATACC (2)
CCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
TGTTTTGAAG
TTATGTGTAA (3)
65.20.0652
P10.5 crx+ retinaCCTGTGGTTT (3)
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
17.20.0172
Adult retinalAGAGAATACC (2)
CCCAGGTCTC
GAACAGAACC (2)
GGCACTGTCC
GGGCAGCTGG
TTCCTGCTGC (2)
16.90.0169
ONLGAACAGAACC (2)
GGGCAGCTGG
TGGACACTTT (2)
11.40.0114