Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.4419	Rpl5	ribosomal protein L5	5	5 58.5 cM	19983
Gene Ontology	5S rRNA binding | cytosolic ribosome (sensu Eukarya) | intracellular | protein biosynthesis | ribosome | ribosome biogenesis | rRNA binding | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPL5[ribosomal protein L5]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 175 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACCTTCAAA ACAAATTATG (2) AGAAGAAGCC AGCTTTCTTA ATGGAGGAGA ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CGCTACCTAA CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GACAAGATCT TCTGGAGTTA TGCATATGCT TTCCACACTC (2) TTGAAATGAA (2) TTTAAAAAAG 133.5 0.1335 Cb medulloblastoma ACAAATTATG (2) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTGACCCTGG (3) 57.9 0.0579 P8 GC+1d culture ACAAATTATG (2) AGCTTTCTTA ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CGCCACCAAT CGCTACCTAA CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GACAAGATCT GTAACCAAAA (2) GTGACCCTGG (3) TGCATATGCT TTGCTATCCG 109.3 0.1093 P8 GC+SHH+1d culture ACAAATTATG (2) ATGGAGGAGA ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CGCCACCAAT CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GGGTACTATG GTAACCAAAA (2) GTAATAAATG (3) GTGACCCTGG (3) TGCATATGCT 126.4 0.1264 3T3 fibroblasts ATGTGCTTCC (2) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTAACCAAAA (2) TGCATATGCT TTGCTATCCG 129.6 0.1296 E15 cortex CTGCTATCCG TGCATATGCT TTGCTATCCG 93.9 0.0939 P1 cortex ACAAATTATG (2) CTGCTATCCG TACCATAAAA (4) TGCATATGCT 59 0.059 Hypothalamus ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GGGTACTATG GTAACCAAAA (2) TCTGGAGTTA TGCATATGCT TTCCACACTC (2) TTGAAATGAA (2) TTTAAAAAAG 79.5 0.0795 E12.5 retina ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GGGTACTATG GTAACCAAAA (2) TGCATATGCT TTGAAATGAA (2) 161.7 0.1617 E14.5 retina AACTTTCAAA (2) ACAAATTATG (2) AGCTTTCTTA ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CGCTACCTAA CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GACAAGATCT GTAATAAATG (3) TCTGGAGTTA TGCATATGCT TTCCACACTC (2) 101.8 0.1018 E16.5 retina ACAAATTATG (2) AGAAGAAGCC AGCTTTCTTA ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CGCCACCAAT CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GACAAGATCT GTAACCAAAA (2) TACCATAAAA (4) TCTGGAGTTA TGCATATGCT 132 0.132 E18.5 retina AACCTTCAAA ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GACAAGATCT GTGACCCTGG (3) TCTGGAGTTA TGCATATGCT 119.9 0.1199 P0.5 retina ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTAACCAAAA (2) TGCATATGCT 147.4 0.1474 P2.5 retina AACTTTCAAA (2) ACAAATTATG (2) AGCTTTCTTA ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTAACCAAAA (2) GTGACCCTGG (3) TCTGGAGTTA TGCATATGCT 89.9 0.0899 P4.5 retina AACTTCAAAA AACTTTCAAA (2) ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTAACCAAAA (2) 85.3 0.0853 P6.5 retina AACTTTCAAA (2) ACAAATTATG (2) CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTAATAAATG (3) TGCATATGCT 78.4 0.0784 P10.5 crx- retina AACTTTCAAA (2) ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG TGCATATGCT 83.6 0.0836 P10.5 crx+ retina AACTTCAAAA ACAAATTATG (2) AGAAGAAGCC ATGGAGGAGA CACCCACCAA (3) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG TGCATATGCT TTCCACACTC (2) TTGCTATCCG 82.6 0.0826 Adult retinal AACTTCAAAA ACAAATTATG (2) ATGTGCTTCC (2) CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG 52 0.052 ONL ACAAATTATG (2) CGCTACCTAA CTGCAGCCTA (3) CTGCTATCCG GTAACCAAAA (2) GTGACCCTGG (3) TTTAAAAAAG 43.9 0.0439