Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.87611 Cul1cullin 1 6  6 B3  26965 
 Mm.87611 AW743318expressed sequence AW743318 6    101402 
 Mm.87611 A930035D04RikRIKEN cDNA A930035D04 gene 6    320946 
 Mm.87611 9430013L14RikRIKEN cDNA 9430013L14 gene 6    77241 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 10 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 69 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATAATGACAT (2)
CTACCGCACT (4)
GAGCTCTGCT (2)
GCAACAGCGC (2)
11.30.0113
Cb medulloblastomaATAATGACAT (2)
CGGTACCAAA
CTACCGCACT (4)
GCCTCTGCTT (5)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureATAATGACAT (2)
CTACCGCACT (4)
GACTGAAGCA (4)
GAGAGATGTT (4)
GCCTCTGCTT (5)
11.20.0112
P8 GC+SHH+1d cultureATAATGACAT (2)
CTACCGCACT (4)
GAAGGTTCGG (4)
GACTGAAGCA (4)
GAGCTCTGCT (2)
GCAACAGCGC (2)
GCCTCTGCTT (5)
19.90.0199
3T3 fibroblastsCTACCGCACT (4)
GTCATAGCTG (2)
280.028
E15 cortexCTACCGCACT (4)
GTCATAGCTG (2)
19.70.0197
P1 cortexCGGTACCAAA
GACTGAAGCA (4)
GAGAGATGTT (4)
GCCTCTGCTT (5)
180.018
HypothalamusCGGTACCAAA
CTACCGCACT (4)
GAAGGTTCGG (4)
5.40.0054
E12.5 retinaCTACCGCACT (4)
7.50.0075
E14.5 retinaCTACCGCACT (4)
GAGAGATGTT (4)
GAGCTCTGCT (2)
GCCTCTGCTT (5)
200.02
E16.5 retinaCTACCGCACT (4)
GCCTCTGCTT (5)
5.40.0054
E18.5 retinaCTACCGCACT (4)
TATTCATAGA (4)
5.40.0054
P0.5 retinaCTACCGCACT (4)
GTCATAGCTG (2)
25.50.0255
P2.5 retinaCTACCGCACT (4)
GCCTCTGCTT (5)
GTCATAGCTG (2)
8.90.0089
P4.5 retinaATAATGACAT (2)
CATTTGTACA (4)
CTACCGCACT (4)
GAAGGTTCGG (4)
GTCATAGCTG (2)
100.01
P6.5 retinaCATTTGTACA (4)
CTACCGCACT (4)
GCCTCTGCTT (5)
GTCATAGCTG (2)
16.60.0166
P10.5 crx- retinaCTACCGCACT (4)
GCCTCTGCTT (5)
TATTCATAGA (4)
31.60.0316
P10.5 crx+ retinaCTACCGCACT (4)
GAAGGTTCGG (4)
GCCTCTGCTT (5)
21.20.0212
Adult retinalATAATGACAT (2)
CTACCGCACT (4)
GAGAGATGTT (4)
GCCTCTGCTT (5)
GTCATAGCTG (2)
22.40.0224
ONLCTACCGCACT (4)
GCCTCTGCTT (5)
GTCATAGCTG (2)
TATTCATAGA (4)
190.019