Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.9537	Lcn2	lipocalin 2	2	2 27.0 cM	16819
Gene Ontology	binding | extracellular space | transport | transporter activity
Human Homolog	LCN2[lipocalin 2 (oncogene 24p3)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 105 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCCCACAAAA GCGAACTGGT (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 31 0.031 Cb medulloblastoma CCCCACAAAA GTGGCTGGTG (2) 13.8 0.0138 P8 GC+1d culture CCCCAAAAAA CCCCACAAAA CCCCCAAAAA (2) CCCCCACAAA CCCCCACTTA CCCCCACTTC GCGAACTGGT (2) GGTCCTTTTG (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) TCACCTCCAT 87.8 0.0878 P8 GC+SHH+1d culture CCCAAAAAAA (2) CCCCAAAAAA CCCCACAAAA CCCCCAAAAA (2) CCCCCACAAA CCCCCACTTA CCCCCACTTC GGTCCTTTTG (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 83 0.083 3T3 fibroblasts GCGAACTGGT (2) GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) 35 0.035 E15 cortex CCCAAAAAAA (2) GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) 24.6 0.0246 P1 cortex GTGGCTGGTG (2) 9.1 0.0091 Hypothalamus CCCCACAAAA CCCCCAAAAA (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) TCACCTCCAT 23.5 0.0235 E12.5 retina CCCCACAAAA GGTTCCTTTT (2) GTGGCTGGTG (2) TCCCCCAAAA 28.2 0.0282 E14.5 retina CCCCAAAAAA CCCCACAAAA CCCCCACTTC GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 30.9 0.0309 E16.5 retina CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) TCCCCCAAAA 34.3 0.0343 E18.5 retina CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GGTCCTTTTG (2) GGTTCCTTTT (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) TCCCCCAAAA 39.9 0.0399 P0.5 retina CCCAAAAAAA (2) GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) 23.6 0.0236 P2.5 retina CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GGTCCTTTTG (2) GGTTCCTTTT (2) GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 47.6 0.0476 P4.5 retina CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GGTCCTTTTG (2) GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 31.8 0.0318 P6.5 retina CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) TCACCTCCAT TCCCCCAAAA 38.2 0.0382 P10.5 crx- retina CCCCACAAAA GGTTCCTTTT (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 13.1 0.0131 P10.5 crx+ retina CCCCACAAAA CCCCCAAAAA (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) 23.1 0.0231 Adult retinal CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) TCACCTCCAT TCCCCCAAAA 29.8 0.0298 ONL CCCAAAAAAA (2) CCCCACAAAA GGTCCTTTTG (2) GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) TATTTATTCA (3) TCACCTCCAT TCCCCCAAAA 32.4 0.0324