Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.159684	Tmpo	thymopoietin	10	10 C2 (10 49.0 cM)	21917
Mm.159684	5830485P09Rik	RIKEN cDNA 5830485P09 gene	10		76121
Mm.159684	AW547477	expressed sequence AW547477	10		103472
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 84 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCATTTTTTA (5) GAAGTCCTAC (3) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TATGGCTTAG (3) TGGATAAAAA (4) TTTTGCCTTA (3) 52.2 0.0522 Cb medulloblastoma CCATTTTTTA (5) TACCTGTGAA (4) TGGATAAAAA (4) 13.8 0.0138 P8 GC+1d culture CCATTTTTTA (5) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TATGGCTTAG (3) 19.4 0.0194 P8 GC+SHH+1d culture CCATTTTTTA (5) GAAGTCCTAC (3) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TATGGCTTAG (3) TGGATAAAAA (4) TGGCTCATCT (4) TTTTACCTGG (3) TTTTGCCTTA (3) 44.5 0.0445 3T3 fibroblasts CCATTTTTTA (5) GACACCGAGA (3) 7 0.007 E15 cortex GTGATGTAAT (3) 9.9 0.0099 Hypothalamus GTGATGTAAT (3) TGGCTCATCT (4) 3.6 0.0036 E12.5 retina CCATTTTTTA (5) GAAGTCCTAC (3) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TAGAAAATAA (3) TATGGCTTAG (3) TTTTACCTGG (3) TTTTGCCTTA (3) 56.6 0.0566 E14.5 retina CCATTTTTTA (5) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TTTTACCTGG (3) TTTTGCCTTA (3) 32.7 0.0327 E16.5 retina CCATTTTTTA (5) GACACCGAGA (3) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TAGAAAATAA (3) TTCTGGTCTC (3) TTTTGCCTTA (3) 32.5 0.0325 E18.5 retina CCATTTTTTA (5) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TAGAAAATAA (3) TATGGCTTAG (3) TGGATAAAAA (4) TTTTACCTGG (3) TTTTGCCTTA (3) 50.8 0.0508 P0.5 retina CCATTTTTTA (5) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TTCTGGTCTC (3) TTTTACCTGG (3) TTTTGCCTTA (3) 57 0.057 P2.5 retina CCATTTTTTA (5) GAAGTCCTAC (3) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TTTTACCTGG (3) 38.9 0.0389 P4.5 retina CCATTTTTTA (5) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TATGGCTTAG (3) TGGCTCATCT (4) 27.8 0.0278 P6.5 retina CCATTTTTTA (5) GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) 11.7 0.0117 P10.5 crx- retina GTGATGTAAT (3) TATGGTTAGA (3) 9.3 0.0093 P10.5 crx+ retina GTGATGTAAT (3) TACCTGTGAA (4) TATGGTTAGA (3) 11.5 0.0115 Adult retinal CCATTTTTTA (5) TACCTGTGAA (4) 3.8 0.0038 ONL GTGATGTAAT (3) TATGGTTAGA (3) 7.6 0.0076