Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.30012 BB136667expressed sequence BB136667 1    98743 
 Mm.30012 Hdlbphigh density lipoprotein (HDL) binding protein 1  1 55.3 cM  110611 
 Gene Ontology cholesterol metabolism | lipid transport | lipid transporter activity | nucleic acid binding | nucleus | RNA binding
 Human Homolog HDLBP[high density lipoprotein binding protein (vigilin)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
16.40.0164
Cb medulloblastomaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
11.50.0115
P8 GC+1d cultureAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAGGAATGTG (3)
TATTCAGCAC (2)
20.50.0205
P8 GC+SHH+1d cultureAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
15.30.0153
3T3 fibroblastsACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
CAGGAGACAG (2)
77.10.0771
E15 cortexTAGTCAGCAC (2)
4.90.0049
P1 cortexAATATGGATG (4)
CAAAGGCTTT (2)
90.009
HypothalamusAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAGGAGACAG (2)
90.009
E12.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAGGAATGTG (3)
28.10.0281
E14.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
TAGTCAGCAC (2)
16.40.0164
E16.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
GAGGAATGTG (3)
TAGTCAGCAC (2)
25.40.0254
E18.5 retinaACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
21.80.0218
P0.5 retinaACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
9.90.0099
P2.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
GAGGAATGTG (3)
TAGTCAGCAC (2)
7.20.0072
P4.5 retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
11.90.0119
P6.5 retinaAATATGGATG (4)
50.005
P10.5 crx- retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAGGAATGTG (3)
20.40.0204
P10.5 crx+ retinaAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
CAAAGGCTTT (2)
TAGTCAGCAC (2)
TATTCAGCAC (2)
13.40.0134
Adult retinalAATATGGATG (4)
ACCTCCAGGA (3)
14.80.0148
ONLAATATGGATG (4)
ACCTCAGGAA (2)
ACCTCCAGGA (3)
GAGGAATGTG (3)
17.20.0172